Сравнительная и превосходная степень прилагательных

Для сравнения вещей используются сравнительная или превосходная степени прилагательных или наречий.
Превосходная степень прилагательных используется для того, чтобы показать, что объект имеет наиболее или наименее выраженное качество; в то время как сравнительная степень наречия спользуется для того, чтобы показать, что объект проявил действие наилучшим или наихудшим образом.

Степени Прилагательных

У прилагательных есть три степени сравнения.
Качественная степень, сравнительная и превосходная:

Update Required
To play the media you will need to either update your browser to a recent version or update your Flash plugin.

• John is tall, but Bill is taller than John.
  Джон высокий но Билл выше чем Джон.
• Jack is very tall. He is the tallest man in the team.
  Джек очень высокий. Он самый высокий мужчина в команде.

Односложные прилагательные — образование сравнительной и превосходной степеней

Двусложные прилагательные — Образование Сравнительной и Превосходной степени

Двусложные прилагательные, оканчивающиеся на: -y, —er, -le, -ow, (и другие)

Длинные прилагательные — образование сравнительной и превосходной степеней

Образование сравнительных и превосходных степеней.

Исключения из правил.

*further также может означать ‘дополнительный’
(further information: Дополнительная информация)

Степени сравнения прилагательных в английском языке

В английском языке имена прилагательные образуют две степени сравнения: сравнительную (comparative degree) и превосходную (superlative degree).

Сравнительная и превосходная степень односложных прилагательных

•  Односложные прилагательные образуют сравнительную степень путем прибавления суффикса -er. Превосходная степень образуется при помощи суффикса -est. Перед прилагательным в превосходной степени употребляется артикль the.

old-older-the oldest

cold-colder-the coldest

•  Таким же образом образуют степени сравнения прилагательные, оканчивающиеся  на —y, (friendly, wealthy, easy, etc.) и некоторое двусложные прилагательные (clever, quiet, narrow, etc.).

friendly-friendlier-the friendliest

clever-cleverer— the cleverest

•  Обратите внимание на следующие правила орфографии при образовании степеней сравнения при помощи суффиксов -er, -est.

•  Если прилагательное оканчивается на немое -e, то при прибавлении суффиксов -er, -est немое e опускается.

large-larger-the largest

brave-braver-the bravest

•  Если прилагательное оканчивается на согласную с предшествующим кратким гласным звуком, то в сравнительной и превосходной степени конечная согласная буква удваивается.

big-bigger-the biggest

hot-hotter-the hottest

thin-thinner-the thinnest

•  Если прилагательное оканчивается на -y с предшествующей согласной, то в сравнительной и превосходной степени y переходит в i.

busy-busier-the busiest

dirty-dirtier-the dirtiest

Сравнительная и превосходная степень двусложных и многосложных прилагательных

Большинство двусложных прилагательных, а также прилагательных, состоящих из трех и более слогов, образуют сравнительную степень при помощи слов  more/less, а превосходную — the most/the least. Эти слова  ставятся перед прилагательным.

modern-more/less modern-the most/the least modern

difficult-more/less difficult-the most/the least difficult

(not) as…as just as…as

Мы также можем использовать not as…as, as…as, just as…as, чтобы выразить сравнение. В этом случае форма прилагательного не меняется.

Creating a website is not as difficult as you think. — Создать веб-сайт не так сложно, как Вам кажется. 

Прилагательные, образующие степень сравнения от другого корня

Некоторые прилагательные и наречия образуют степени сравнения от другого корня.

good/well-better-the best

bad/badly-worse-the worst

far-farther/further-the farthest/furthest

Much, a lot, far, a bit, a little, slightly, the…the с прилагательными в сравнительной степени

Перед прилагательными в сравнительной степени можно использовать  much/ a lot/ far (=a lot) (гораздо),  a little, slightly (немного, слегка), the. ..the (чем… тем).

The younger you are, the easier it is to learn a new language. — Чем ты моложе, тем легче выучить новый язык.

Let’s catch a bus, it’s much cheaper than taking a taxi. — Давай поедем на автобусе, получится гораздо дешевле, чем на такси.

Present Perfect и превосходная степень сравнения прилагательных

Present Perfect часто используется вместе с превосходной степенью прилагательных и ever.

He is one of the most interesting people I have ever met. — Он один из самых интересных людей, которых я когда-либо встречал.

What is the best concert you’ve ever been to? — Какой концерт  из всех, что Вы когда-либо посетили, был самый лучший?

old-older/elder-the oldest/the eldest

Мы можем использовать  elder и the eldest, наряду с older и oldest, когда говорим о членах семьи.

Are you the eldest (the oldest) in your family? — Ты самый старший в семье?

My elder (older) sister is a vet. — Моя старшая сестра — ветеринар.

most — другие значения

•  Most перед прилагательными используется не только для образования превосходной степени, но и со значением очень, крайне, весьма.

Thank you for your help. It was most kind of you. -Спасибо Вам за помощь. Вы были очень добры.

•  Most употребляется перед существительными со значением большинство, большая часть.

Most people in his country are involved in agriculture. — Большинство людей в его стране занимается сельским хозяйством.
 

Поделитесь записью

Степени сравнения прилагательных в английском языке

В английском языке существует три степени прилагательных:

• Положительная (positive) – изначальная форма прилагательного, обозначающая какое-либо качество: old, nice, big, etc.
• Сравнительная (comparative) – используется при сравнении двух предметов.
• Превосходная (superlative) – используется при сравнении трех и более предметов («самый»). Как правило, здесь ещё добавляется определённый артикль the.

Способы образования степеней сравнения

• Односложные прилагательные: добавляются суффиксы –er и –est:

cheap – cheaper – the cheapest / дешёвый – дешевле – самый дешёвый

• Односложные прилагательные, оканчивающиеся на букву e – добваляются только –r и –st:

nice – nicer – the nicest / милый – милее – самый милый

• Односложные прилагательные, оканчивающиеся на согласную, перед которой идёт короткая гласная – последняя буква удваивается:

big – bigger – the biggest / большой – больше – самый большой

hot – hotter – the hottest / горячий – горячее – самый горячий

• Двусложные прилагательные, оканчивающиеся на букву y – y меняется на i, затем также добавляются суффиксы –er и –est:

happy – happier – the happiest / счастливый – счастливее – самый счастливый

• Слова, состоящие из двух и более слогов (кроме пункта 4) – степени сравнения образуются с помощью слов more и the most:

expensive – more expensive – the most expensive / дорогой – дороже – самый дорогой

• С некоторыми двусложными прилагательными можно использовать оба способа. Например, это такие слова, как clever, narrow, quiet, shallow, simple:

This street is narrower / more narrow than the road. – Эта улица уже, чем шоссе.

Good – better – the best / хороший – лучшей – самый лучший

Bad – worse – the worst / плохой – хуже – самый плохой

Little – less – the least / маленький – меньше – самый маленький

Much/Many – more – the most / много – больше – самый большой

• Два варианта образования:

Evelyn is older than Mary. – Эвелин старше Мэри.

Luke is my elder brother. – Люк мой старший брат.

For further information, visit our website. – Для получения дальнейшей  информации посетите наш сайт.

The farthest house is Mike’s. – Самый дальний дом – это дом Майка.

The nearest shop is at the corner. – Ближайший магазин находится на углу.

The next building is a library. – Следующее здание – это библиотека.

Please call back later. – Пожалуйста, перезвоните позже.

The last lesson is Math. – Последний урок – математика.

При использовании сравнительной степени употребляется союз than – чем.

New York is larger than Bath. – Нью—Йорк больше, чем Бат.

При использовании превосходной степени используется выражение of all – из всех.

Anna is the youngest of all. – Анна самая младшая из всех.

Для усиления можно использовать следующие слова и выражения:

Much / a lot / far – намного

A little / a bit – ненамного

Например:

Alex is much taller than Jim. – Алекс намного выше Джима.

Kate is a bit taller than Sue. – Кейт немного выше Сью.

Если мы хотим сравнить прилагательные в меньшую сторону, мы использует слова less и the least:

This flat is less expensive than that house. – Эта квартира менее дорогая, чем тот дом.

Также можно просто заменить слово на противоположное по значению:

This flat is cheaper than that house. – Эта квартира дешевле, чем тот дом.

При употреблении двух сравнительных степеней сравнения и артикля the получается конструкция «чем … , тем …»:

The sooner, the better. – Чем скорее, тем лучше.

Степени сравнения прилагательных (DEGREES OF COMPARISON) в английском языке

СОДЕРЖАНИЕ:

1.  Как употреблять СТЕПЕНИ СРАВНЕНИЯ ПРИЛАГАТЕЛЬНЫХ (DEGREES OF COMPARISON)?

2. Окончания y, er, ow

3. Удвоение согласной

4. Изменение «y» на «i«

5. Многосложные прилагательные (more / most)

6. Двухсложные прилагательные (ing / ed / ful / less)

7. Многосложные прилагательные (less / least)

8. Прилагательные в двух степенях сравнения (er / most)

9. ИСКЛЮЧЕНИЯ (good / better / the best)

10. Less and Small

11. Farther and Further

12. Elder and Older

Как употреблять СТЕПЕНИ СРАВНЕНИЯ ПРИЛАГАТЕЛЬНЫХ (DEGREES OF COMPARISON)?

Односложные прилагательные

Если односложные прилагательные (dark, fast) или двухсложные прилагательное заканчивающееся на y, er, ow (clever, narrow, gray) и мы хотим перевести их в сравнительную или превосходную степень, то сравнительная степень от такого прилагательного образуется путем добавлением к нему суффикса «er», а превосходная «est».

Окончания y, er, ow

Удвоение согласной

Если односложное прилагательное заканчивается на согласную стоящую после краткой гласной, то перед суффиксом «er» или «est» она удваивается.

Изменение «y» на  «i»

Если двухсложное прилагательное заканчивается на «y», которая стоит после согласной, то при присоединении суффикса «er» или «est», «y» меняется на «i».

Многосложные прилагательные (more/most)

Если прилагательное многосложное, то оно образует степень сравнения при помощи «more» и «most».

Двухсложные прилагательные (ing / ed / ful / less)

Это же относится к двухсложным прилагательным НЕ заканчивающимся на  «y», «er», «ow», но заканчивающимся на «ing», «ed», «ful», «less».

Многосложные прилагательные (less/least)

Для выражения степени сравнения, но уже в меньшую сторону используется less (менее) и least (меньше всего).

Прилагательные в двух степенях сравнения (er / most)

Некоторые прилагательные могут употребляться в двух степенях сравнения «er» и «most».

ИСКЛЮЧЕНИЯ (good / better / the best)

Следующие степени сравнения надо просто запомнить.

Less and Small

Less используется, когда мы говорим о количестве.

Small  используется, когда мы говорим о размере.

I have less money than he.

This car is smaller than that one.

Farther and Further

far — farther — farther – когда мы говорим о расстоянии.

It was farther than I thought – это было дальше, чем я думал.

far – further – furthest – используется более широко.

Further education — дальнейшее образование.

Elder and Older

old – elder – eldest – старшинство в семье.

My elder brother – мой старший брат.

old – older – oldest —  возраст.

This car is older than that one – эта машина старше той.

Дополнительная информация.
Most может употребляться в значении very.

They are most clever animals

 Written by Igor Shavkunov

Сравнительная степень прилагательных.

√ Степени сравнения прилагательных 
√ Односложные
√ Многосложные
√ Особые случаи.

Изменяться по степени сравнения могут только качественные прилагательные, которые обозначают какие-либо качества предмета и чье значение может быть выражено в большей или меньшей степени.
   
Существует три степени сравнения прилагательных.

положительная, сравнительная и превосходная.
    Right- righter — rightest
    верный(положительная) – вернее(сравнительная) – наивернейший (превосходная)
   
Прилагательные в превосходной степени обычно используются в комбинации с определенным артиклем the. Исключениями могут стать предложения, где имеется в виду очень высокая степень качества, а не сравнение с другим предметом:
    Sunrises are most captivated here.
    Здесь необычайно захватывающие восходы.
   
Степени сравнения прилагательных образуются при помощи суффиксов -er и -est, при помощи слов more-most, less-least и исключения, как good-better-best.

Суффикс —er добавляется к односложному (один слог) и к двухсложным прилагательным с ударением на последний слог:
    new – newer – newest
    polite – politer – politest
   
Также сюда входят двусложные слова оканчивающиеся на —ble, -er, -y, -some, -ow:
    noble – nobler – noblest
    tender – tenderer – tenderest
    happy – happier – happiest
    narrow – narrower – narrowest
   
При прибавлении суффиксов -er и -est нужно помнить о следующих правилах орфографии:
    Немое -e в конце слов опускается:
    large – larger – largest
    brave – braver – bravest
 
 Чтобы сохранить краткость звука, в сравнительной и превосходной степени конечная согласная удваивается:
    hot – hotter – hottest
    big – bigger – biggest
 
 Если прилагательное оканчивается букву -y после согласной и , то в сравнительной и превосходной степени конечная -y заменяется на -i:
  easy – easier – easiest
  dirty – dirtier – dirtiest
   
Перед многосложными прилагательным ставятся слова more/most (более/наиболее), less/least (менее/наименее):
   
effective – more effective – most effective
dangerous – more dangerous – most dangerous
   
Некоторые прилагательные в английском языке образуют степени сравнения не по общим правилам:
good – better – best
bad – worse – worst
little – less – least
many – more – most
far – farther/further – farthest /furthest
old – older/elder – oldest/eldest
   
Обратите внимание на различие в значении слов farther/further и older/elder.
    farther – farthest дальше — самый далекий (используется о расстояния):
    I live farther from home than Mark.
    Я живу дальше от дома, чем Марка.
   
further – furthest переводится как дальнейший и самый далекий:
    You can find further information about Putin’s biograpy in the reference book.
    В справочнике вы сможете найти дальнейшую информацию о биографии Путина.
   
elder – eldest обозначает старшинство в семье:
    his elder brother lives in Brest.
    Его старший брат живет в Бресте
    older – oldest обозначает возраст:
    This is the oldest church in Brest.
    Это самая старая церковь в Бресте.
   
Сложные прилагательные образуют степени сравнения при помощи слов more—most:
   
     light-minded – more light-minded – most light-minded
   
или посредством изменения первого элемента (если это прилагательное или наречие):
   
    well-known – better-known – best-known
    good-looking – better-looking – best-looking

Ex. 1

Hot, long, short, clever, silly, great, red, black,
white, thin, thick, fat, nice, warm, cold, merry, 
small, tall, high, weak, strong, heavy, light, green

Степени сравнения прилагательных в английском языке (Degrees of Comparison of Adjectives)

Как в русском, так и в английском языке прилагательные имеют три степени сравнения: положительную, сравнительную и превосходную.

Положительная степень прилагательных в английском языке используется в следующих конструкциях:

as … as – «так(ой) же … как и», «одинаковый», и т.д.

Например:
Jane is as tall as John.
Джейн такого же роста, как и Джон. (= Джейн и Джон одного роста.)

not as … as / not so … as – «не такой … как«.

Например:
John is not as tall as Arnie.
Джон не такой высокий, как Арни.

Сравнительная и превосходная степени прилагательных в английском языке образуются двумя способами.

В первом случае, если прилагательное является односложным, т.е. состоит из одного слога (например, clean, new, cheap) или из двух, где второй слог заканчивается на –y или -er, то степени сравнения таких прилагательных образуются прибавлением окончаний -er и -est.

Обратите внимание на орфографические изменения при образовании степеней сравнения односложных прилагательных:

— непроизносимая «e» на конце опускается, например:

late – later – the latest

— если слово заканчивается на -y, перед которой следует согласная, то «y» меняется на «i«, например:

easy – easier – the easiest

— если слово заканчивается на согласную, перед которой следует короткая ударная гласная, то конечная согласная удваивается, например:

hot – hotter – the hottest

Во втором случае, если прилагательное состоит из трех и более слогов, либо из двух слогов, где второй слог оканчивается не на -y и -er, то степени сравнения таких прилагательных образуются при помощи слов more и most.

Некоторые прилагательные могут образовываться обоими способами, например:

narrow – narrower/more narrow – the narrowest/the most narrow
shallow – shallower/more shallow – the shallowest/the most shallow
quiet – quieter/more quiet – the quietest/the most quiet

Обратите внимание на то, что прилагательному в превосходной степени предшествует определенный артикль the. Этому существует вполне логичное объяснение – превосходная степень выделяет предмет или понятие из ряда ему подобных благодаря максимальному наличию того или иного признака. Следовательно, мы говорим практически о единственном в своем роде (или данной группе) предмете.

Перед прилагательными в сравнительной степени возможно употребление усилительных слов much, a lot, far – в значении «гораздо», «намного», и т.п., a little, a bit, slightly – в значении «не(на)много», «чуть-чуть», и т.п.

Например:
Let’s go by plane. It’s much faster and much more comfortable.
Давайте полетим самолетом. Так намного быстрее и гораздо удобнее.

My brother is a little taller and slightly more intelligent than yours.
Мой брат немного выше и чуть-чуть умнее твоего.

Повторение прилагательных в сравнительной степени означает продолжительность или продолжение (в подобных случаях аналогичную функцию выполняет русское «все«), например:

More and more people were coming.
Люди все подходили и подходили.

He was getting older and older.
Он становился все старше.

Перед прилагательным в сравнительной степени возможно употребление неопределенных местоимений any и no, например:

This report wasn’t any better than the previous one.
Этот доклад был ничуть не лучше предыдущего.

You are no better than me.
Ты ничем не лучше меня.

Если вы хотите подчеркнуть зависимость одного действия от другого, можно использовать выражение
the + прилагательное в сравнительной степени + the + прилагательное в сравнительной степени,
которое переводится как «чем … тем«, например:

The sooner you’ll start, the sooner you’ll finish.
Чем скорее вы начнете, тем скорее закончите.

The richer you are the more difficult your life is.
Чем вы богаче, тем сложней ваша жизнь.

Обратите внимание на следующие прилагательные, степени сравнения которых образуются иначе, чем указано выше. Эти прилагательные и их производные нужно просто запомнить.

НОУ ИНТУИТ | Лекция | Степени сравнения прилагательных

Аннотация: В этой лекции вы узнаете, по каким правилам образуются степени сравнения прилагательных, какие исключения из общих правил существуют в современном английском языке. Предложенные упражнения помогут вам научиться следовать общим правилам и выучить исключения.

Прилагательные. Краткие сведения.

Прилагательные (Adjectives) — это слова, которые выражают качества, признаки предметов. Они отвечают на вопрос какой?. В предложении они, как правило, определяют существительное. В английском языке они не изменяются ни по родам, ни по числам, ни по падежам:

a little girl – маленькая девочка

a little boy – маленький мальчик

little children – маленькие дети

with a little boy – с маленьким мальчиком.

Прилагательные изменяются только по степеням сравнения (Degrees of Comparison). Существует три степени сравнения прилагательных: положительная (Positive Degree), сравнительная (Comparative Degree), превосходная (Superlative Degree).

Правила образования степеней сравнения прилагательных.

Прилагательные в положительной степени не имеют никаких окончаний, например: quick (быстрый), slow (медленный), old (старый), new (новый). Сравнительная и превосходная степени образуются с помощью суффиксов -er и -est или путем прибавления слов more (более) и most (самый). Выбор способа зависит от исходной формы прилагательного.

Односложные и некоторые двусложные прилагательные образуют сравнительную степень при помощи суффикса -er, а превосходную степень при помощи суффикса -est. С помощью суффиксов -er, -est образуют степени сравнения двусложные прилагательные, оканчивающиеся на -er, -ow, -y , -le (clever, narrow, early, simple).

Приведем примеры:

Односложные и двусложные прилагательные

intuit.ru/2010/edi»>При письме должны соблюдаться определенные правила орфографии.

1. Если прилагательное имеет краткую гласную и оканчивается на одну согласную, то в сравнительной степени и в превосходной степени эта согласная удваивается:

big – bigger – biggest

большой – больше – наибольший, самый большой

fat – fatter – fattest

толстый, жирный – толще – самый толстый

wet – wetter – wettest

мокрый, влажный – более влажный – самый влажный

sad – sadder – saddest

печальный, грустный – более грустный – самый грустный

thin – thinner – thinnest

intuit.ru/2010/edi»>тонкий, худой – более тонкий – самый тонкий

2. Если прилагательное оканчивается на букву -y с предшествующей согласной, то в сравнительной и превосходной степенях буква y меняется на i:

easy – easier – easiest

легкий – легче – наилегчайший, самый легкий

early – earlier – earliest

ранний – более ранний – самый ранний

dry – drier – driest

сухой, засушливый – более сухой – самый сухой

Но слово shy (застенчивый, пугливый) не подчиняется этому правилу и образует степени сравнения следующим образом:

shy – shyer – shyest.

intuit.ru/2010/edi»>3. Если прилагательное оканчивается на букву -e , то в сравнительной и превосходной степенях прибавляется -r, -st:

wide – wider – widest

широкий – шире – широчайший, самый широкий

late – later – latest

поздний – более поздний – самый поздний

fine – finer – finest

хороший, прекрасный – лучше – самый хороший

simple – simpler – simplest

простой – проще – самый простой

Многосложные прилагательные, т.е. прилагательные, состоящие из трех и более слогов, образуют степени сравнения с помощью слов more для сравнительной степени и most для превосходной степени. Рассмотрим следующие примеры:

Многосложные прилагательные

intuit.ru/2010/edi»>Таким же способом, т.е. с помощью слов more для сравнительной степени и most для превосходной степени, образуют степени сравнения некоторые двусложные слова, которые заканчиваются на -ed и -ing:

annoyed/annoying

раздраженный, раздосадованный/раздражающий, досадный

bored/boring

скучающий/надоедливый, скучный

amused/amusing

довольный/забавный, смешной.

Например:

boring – more boring – most boring

скучный – более скучный – самый скучный.

Если прилагательное оканчивается на -ful или -less, то оно всегда образует сравнительную и превосходную степени сравнения с помощью слов more для сравнительной степени и most для превосходной степени. Приведем примеры таких прилагательных:

careful (заботливый, старательный, внимательный), careless (небрежный, беззаботный), useful (полезный), useless (бесполезный).

Таким же способом образуют степени сравнения прилагательные certain (уверенный, верный, надежный), correct (правильный, точный, корректный), famous (знаменитый, известный, славный), foolish (глупый), frequent (частый, обычный), modern (современный), normal (нормальный, обычный). Например:

foolish – more foolish – most foolish

глупый – глупее – самый глупый.

Некоторые двусложные прилагательные образуют степени сравнения двумя способами:

pleasant (приятный) – pleasanter – pleasantest;

pleasant – more pleasant – most pleasant.

В качестве примера можно привести также следующие прилагательные:

clever (умный), handsome (красивый, статный), happy (счастливый), narrow (узкий), quiet (спокойный, тихий), shallow (мелкий), simple (простой, простодушный), stupid (глупый).

В случае затруднения рекомендуется употреблять слова more и most для образования степеней сравнения двусложных прилагательных.

TOEIC Грамматика: сравнительная и превосходная

Введение

Для сравнения можно использовать прилагательные и наречия. Они используются, чтобы показать, что отличается или похоже в двух или более вещах. Есть три вида возможных сравнений: равные, сравнительные и превосходные.

Подсказка по обучению:

Формирование сравнительной и превосходной форм обычно зависит от количества слогов в прилагательном. Выучите правила для каждого типа прилагательного и наречия. Не объединяйте два способа сравнения в одном предложении.

Равное сравнение

Прилагательное или наречие используется, чтобы показать, что две вещи имеют одинаковое качество. Качество, разделяемое в одинаковом количестве, означает, что эти две вещи в некотором роде равны.Форма, используемая для такого сравнения, — прилагательное / наречие как. Сравнение as as более известно как коррелятивное соединение .

Примеры прилагательного:

Наш босс так же дружелюбен, как ваш.

Ее отпуск длился , а ее отпуск длился человек.

Примеры наречий:

Он работает так же эффективно, как вы.

Его компьютер может загружать файлы так же быстро, как их компьютер.

Сравнительный

Чтобы показать разницу или показать, что есть только сходство между двумя вещами, необходимо использовать сравнительную форму. Прилагательное или наречие превращается в сравнительную форму одним из двух способов. Способ употребления зависит от количества слогов в прилагательном или наречии:

• Большинство односложных прилагательных и наречий имеют окончание — er .
• Двухсложные прилагательные, оканчивающиеся на y, образуют сравнительное, принимая окончание — er .
• Другие двухсложные прилагательные используют более + правильную форму для сравнения.
• Большинство наречий, состоящих из двух или более слогов, должны использовать более + правильную форму для сравнения.
• Все прилагательные, состоящие из трех или более слогов, должны использовать более + правильную форму для сравнения.

Прилагательные:

Примеры:

Она на короче из двух сестер.

Она на короче на сестры.

Этот факсимильный аппарат на новее , чем тот.

Управляющий хочет быть на популярнее , чем предыдущий.

Наречия:

Примеры:

Мы закончили наш проект быстрее , чем они закончили свой.

Новый копировальный аппарат печатает страницы быстрее , чем старый.

Он понимает курс легче , чем она.

Слово , а не обычно используется после сравнительной формы в предложении.

Примечание: Никогда не смешивайте два способа для получения сравнительного результата.

Неправильно: она получает много преимуществ, потому что она здесь на дольше .

Правильно: она получает много преимуществ, потому что она здесь на дольше .

Неправильно: Он работает на быстрее , чем мы.

Правильно: Он работает на быстрее , чем мы.

Превосходная степень

Если сравниваются три или более значений, должна использоваться превосходная форма. Прилагательное или наречие превращается в превосходную форму одним из двух способов. Способ употребления зависит от количества слогов, содержащихся в прилагательном или наречии:

• Большинство односложных прилагательных и наречий имеют окончание — est .
• Двухсложные прилагательные, оканчивающиеся на y, образуют превосходную степень, принимая окончание — est .
• В других двухсложных прилагательных используется наиболее + правильная форма для создания превосходной степени.
• Большинство наречий, состоящих из двух или более слогов, должны использовать наиболее + правильную форму, чтобы получить превосходную степень.
• Все прилагательные с тремя или более слогами должны использовать наиболее + правильную форму, чтобы получить превосходную степень.

Прилагательные:

Примеры:

Это самый современный офис в здании.

Она является самым молодым сотрудником компании, получившим повышение.

( Примечание: Ее сравнивают со всеми другими сотрудниками компании.)

Наречия:

Примеры:

Она быстрее всех находит файлы.

Он говорил наиболее решительно на собрании.

Слово всегда используется перед превосходной формой в предложении.

Примечание: Никогда не смешивайте два способа, чтобы получить превосходную степень.

Неправильно: он был самым мудрым из человек, которых я когда-либо знал.

Правильно: он был самым мудрым из человек, которых я когда-либо знал.

Неправильно: она набирает самых быстрых из всех секретарей.

Правильно: она набирает самых быстрых из всех секретарей.

Неправильные прилагательные и наречия

Есть несколько неправильных прилагательных и наречий. Они не делают сравнительную или превосходную степень так же, как другие. Они не используют ни — er / — est , ни больше / большинство . Запомните их сравнительные и превосходные формы:

Примеры:

Эта программа на лучше на предыдущих.

Эта программа — лучшая из всех.

Неправильно: программное обеспечение, которое мы купили за тысяч штук, было получено у онлайн-поставщика.

Правильно: программное обеспечение, которое мы купили из , из , поступило от онлайн-поставщика.

Неправильно: она должна проехать по далеко от всех в офисе.

Правильно: она должна пройти самых дальних всех в офисе.

Слова без сравнительной и превосходной форм

Не ВСЕ прилагательные и наречия могут иметь сравнительную или превосходную форму.

Никакое сравнение невозможно с некоторыми прилагательными и наречиями. Они не могут показывать большую или меньшую сумму, поэтому могут иметь только одну форму. Некоторые из этих слов: совершенное , уникальное , мертвое , невозможное и бесконечное .

Пример:

Неправильно: он был самым уникальным президентом, который у нас был.

Правильно: он был уникальным президентом .

( Уникальный означает единственный в своем роде . Нет другого подобного ему, поэтому один президент не может быть более или менее уникальным, чем другой .)

Требуется параллельная структура

Сравнение должно иметь смысл. Вы не можете сравнивать очень разные вещи. Они должны быть похожи. Яблоки и апельсины — это фрукты, но это все же два разных вида фруктов.Итак, яблоко нельзя сравнивать с апельсином.

Примеры:

Неправильно: компьютер Майкла намного старше Will .

( Сравнение компьютера с человеком .)

Правильно: компьютер Майкла намного старше, чем компьютер Уилла .

( Сравнение одного компьютера с другим .)

Неправильно: Английский , на котором говорят в Канаде, близок к США .

( Сравнение языка со страной .)

Правильно: английский , на котором говорят в Канаде, близко к , что в Соединенных Штатах.

( Сравнение английского языка в двух странах .)

Список прилагательных в сравнительной превосходной степени от A до Z

Сравнительная превосходная степень и список прилагательных от A до Z

Список сравнительной превосходной степени и прилагательных от A до Z

Распечатать сравнительную превосходную степень и прилагательные от А до Я

Распечатать урок в сравнительной превосходной степени и прилагательных от А до Я. Щелкните правой кнопкой мыши на пустом пространстве и выберите печать. Вы можете щелкнуть значок принтера чуть ниже и справа от кнопки меню «Связаться с нами» в верхней части страницы.

Уроки, которые связаны с этим и с этим

Пищевые прилагательные для описания продуктов питания от А до Я

Порядок прилагательных Грамматика английского языка

Изучение прилагательных что такое прилагательные

Щелкните следующую ссылку, чтобы открыть онлайн-словарь английского языка — Урок английского языка

английских книг, чтобы скачать бесплатно

Скачать словари в формате pdf БЕСПЛАТНО

Сравнительная эффективность и безопасность новых хирургических методов лечения доброкачественной гиперплазии простаты: систематический обзор и сетевой мета-анализ

Резюме

Цель Оценить эффективность и безопасность различных эндоскопических хирургических методов лечения доброкачественной гиперплазии предстательной железы.

Дизайн Систематический обзор и сетевой метаанализ рандомизированных контролируемых исследований.

Источники данных Комплексный поиск в базах данных PubMed, Embase и Cochrane с момента создания до 31 марта 2019 г.

Выборка исследований Рандомизированные контролируемые испытания, сравнивающие вапуризацию, резекцию и энуклеацию простаты с использованием монополярных, биполярных или различных лазерные системы (гольмий, тулий, титанилфосфат калия или диод) в качестве хирургического лечения доброкачественной гиперплазии предстательной железы.Основными исходами были максимальная скорость кровотока (Qmax) и международная оценка симптомов простаты (IPSS) через 12 месяцев после хирургического лечения. Вторичными исходами были значения Qmax и IPSS через 6, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения; периоперационные параметры; и хирургические осложнения.

Извлечение и синтез данных Два независимых обозревателя извлекли данные исследования и выполнили оценку качества, используя Кокрановский инструмент риска смещения. Величины эффекта были суммированы с использованием взвешенных средних разностей для непрерывных исходов и отношения шансов для бинарных исходов.Частотный подход к сетевому метаанализу был использован для оценки сравнительных эффектов и безопасности. Также были рассчитаны вероятности ранжирования каждого лечения.

Результаты Было выявлено 109 испытаний с общим числом участников 13 676. Были оценены девять хирургических вмешательств. Энуклеация достигла лучших значений Qmax и IPSS, чем методы резекции и вапоризации, через шесть и 12 месяцев после хирургического лечения, и разница сохранялась до 24 и 36 месяцев после хирургического лечения.Для Qmax через 12 месяцев после хирургического лечения лучшими тремя методами по сравнению с монополярной трансуретральной резекцией простаты (ТУРП) были биполярная энуклеация (средняя разница 2,42 мл / с (95% доверительный интервал от 1,11 до 3,73)), энуклеация с помощью диодного лазера (1,86 (От -0,17 до 3,88)) и энуклеации с помощью гольмиевого лазера (1,07 (0,07 до 2,08)). Худшим методом было испарение диодного лазера (-1,90 (-5,07 до 1,27)). Результаты IPSS через 12 месяцев после лечения были аналогичны Qmax через 12 месяцев после лечения.Три лучших метода по сравнению с монополярной ТУРП: энуклеация с помощью диодного лазера (средняя разница от −1,00 (−2,41 до 0,40)), биполярная энуклеация (0,87 (−1,80 до 0,07)) и энуклеация с помощью гольмиевого лазера (−0,84 (−1,51 до 0,58)). )). Худшим методом было испарение диодного лазера (1,30 (от -1,16 до 3,76)). Восемь новых методов лучше контролировали кровотечение, чем монополярная ТУРП, что привело к более короткой продолжительности катетеризации, уменьшению послеоперационного снижения гемоглобина, меньшему количеству случаев задержки сгустка и более низкой скорости переливания крови.Тем не менее, кратковременное преходящее недержание мочи все еще может быть проблемой для методов энуклеации по сравнению с методами резекции (отношение шансов 1,92, 1,39 к 2,65). Не было обнаружено существенного несоответствия между прямыми и косвенными доказательствами в отношении первичных или вторичных результатов.

Заключение Восемь новых эндоскопических хирургических методов при доброкачественной гиперплазии предстательной железы оказались более безопасными по сравнению с монополярной ТУРП. Среди этих новых методов лечения методы энуклеации показали лучшие значения Qmax и IPSS, чем методы вапоризации и резекции.

Регистрация исследования CRD42018099583.

Введение

Симптомы нижних мочевых путей, вызванные доброкачественной гиперплазией предстательной железы, являются наиболее частой урологической проблемой среди мужчин, затрагивая около трети мужчин старше 50 лет.12 Хирургическое вмешательство является наиболее эффективным методом лечения доброкачественной гиперплазии предстательной железы, проведено около 100000 процедур ежегодно проводится в США. 3 Из всех хирургических методов лечения с 1970-х годов предпочтительным методом была монополярная трансуретральная резекция простаты (ТУРП), при которой увеличенная ткань простаты резецировалась по частям с использованием монополярного электрода.Он может значительно улучшить максимальную скорость потока (Qmax), симптомы мочеиспускания (на основе международной шкалы симптомов простаты (IPSS)) и качество жизни, связанное со здоровьем, с долгосрочной эффективностью по сравнению с лекарствами или другими минимально инвазивными методами лечения.45 Однако, монополярная ТУРП является рискованной процедурой из-за вероятности серьезных осложнений, таких как массивное кровотечение или синдром трансуретральной резекции.6 Следовательно, необходимо разработать малоинвазивные хирургические методы с результатами, аналогичными результатам монополярной ТУР, но с меньшим количеством побочных эффектов.5

С 2000-х годов быстро стали популярными новые энергетические системы для хирургических вмешательств по лечению доброкачественной гиперплазии предстательной железы, включая системы, использующие биполярную энергию и различные лазерные системы, такие как гольмиевый лазер, калий-титанилфосфатный (KTP) лазер, тулиевый лазер и диодный лазер.78 За последние 10 лет тенденция в хирургическом лечении доброкачественной гиперплазии предстательной железы сместилась с монополярной ТУР на лечение с помощью лазера и биполярной ТУР. Биполярную энергию можно использовать для разреза, резекции и испарения ткани простаты с использованием различных электродов.Лучи гольмиевого и тулиевого лазеров в основном поглощаются водой и действуют как инцизионные лазеры. Лазер KTP избирательно поглощается гемоглобином и разрушает ткань простаты за счет испарения. Диодный лазер поглощается водой, поэтому гемоглобин может испарять и разрезать ткань простаты. Все эти новые методы используют физиологический раствор вместо дистиллированной воды, чтобы избежать гипонатриемии.

В соответствии с принципами лечения новые методы можно разделить на три типа: методы резекции (резекция ткани простаты по частям), методы вапоризации (испарение избыточной ткани предстательной железы) и методы энуклеации (отслаивание увеличенной простаты от простаты). капсула простаты).В таблице 1 приведена номенклатура и сокращенные обозначения девяти хирургических методов, а на рисунке 1 приведено описание хирургических методов. Эти новые методы предназначены для замены монополярной ТУРП, которая является стандартным хирургическим лечением доброкачественной гиперплазии предстательной железы.

Таблица 1

Номенклатура девяти хирургических методов хирургии доброкачественной гиперплазии предстательной железы

Рис. 1

Различные эндоскопические хирургические методы при доброкачественной гиперплазии простаты. (A) Методы энуклеации: удаление всей аденомы простаты из капсулы предстательной железы с помощью лазерного волокна с торцевым возбуждением или специальной биполярной петли, затем морцеллирование аденомы бритвой (B) Методы резекции: резекция увеличенной аденомы простаты с помощью монополярной или биполярной петли резекции , кусочек за кусочком.(C) Методы испарения: выпаривание увеличенной аденомы простаты с помощью лазерного волокна с боковым направлением или биполярного электрода в форме гриба

Целью этого систематического обзора и сетевого метаанализа было исследование новых хирургических методов и определение того, какой из них обеспечивает наилучшие функциональные возможности. результаты с меньшим количеством осложнений путем оценки данных опубликованных рандомизированных контролируемых исследований.

Методы

Стратегия поиска и критерии выбора

Это исследование следовало рекомендациям PRISMA (предпочтительные элементы отчетности для систематических обзоров и метаанализов).9 Метод и анализ были заранее определены и зарегистрированы на сайте PROSPERO (CRD42018099583). Для выявления опубликованных и неопубликованных исследований мы использовали электронные базы данных, включая PubMed (с начала до марта 2019 г.), Embase (с начала по март 2019 г.) и Кокрановские регистры клинических испытаний (с начала до марта 2019 г.) без ограничений по языку или дате, а также ручной поиск литературы. Подробный протокол исследования, включая условия поиска и стратегию, представлен в дополнительном материале и в дополнительной таблице 1.Для включения подходили рандомизированные клинические испытания с параллельными группами, сравнивающие любые два различных хирургических метода. Все методы перечислены в таблице 1. Критериями включения были пациенты с Qmax ниже 15 мл / с и IPSS выше 8. Критериями исключения были пациенты с нейрогенным мочевым пузырем; предыдущие операции на уретре, простате или мочевом пузыре; и подозрение на рак простаты.

Показатели результатов

Показатели результатов для анализа включали:

• Функциональные результаты: Qmax и IPSS через 6, 12, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения

• Периоперационные параметры: продолжительность катетеризации и снижение гемоглобина

• Краткосрочные осложнения, включая синдром трансуретральной резекции, задержку сгустка крови (задержку сгустка крови в мочевом пузыре), переливание крови, инфекцию мочевыводящих путей, повторную катетеризацию и недержание мочи рецидив доброкачественной гиперплазии предстательной железы, требующий повторной операции или повторной апикальной резекции).

Долгосрочные осложнения включались только в том случае, если данные были взяты из испытаний с периодом наблюдения более трех месяцев. Мы выбрали Qmax и IPSS через 12 месяцев после хирургического лечения в качестве первичных исходов, а другие клинические измерения — в качестве вторичных.

Извлечение данных и оценка качества

Два рецензента (S-WH, C-ST) независимо проверяли названия и аннотации на соответствие критериям отбора. Затем полные статьи оценивались по критериям приемлемости.Мы разработали форму для извлечения данных, которую в экспериментальном порядке протестировали в 10 случайно включенных исследованиях, а затем соответствующим образом доработали. Два рецензента (S-WH, C-ST) независимо извлекли данные, а затем перепроверили их. Для оценки качества исследования мы использовали инструмент Cochrane Collaboration’s Risk of Bias.10. Любые неразрешенные несоответствия в извлечении данных или оценке результатов оценивались третьим рецензентом (C-YT), который выступал в качестве арбитра. Мы также применили подход GRADE (классификация рекомендаций, оценка, разработка и оценка) для оценки качества доказательств, касающихся первичных исходов, которые считались критическими при принятии клинических решений.11

Мы попытались связаться с некоторыми авторами по поводу недостающих данных, и несколько авторов ответили. Когда данные о стандартном отклонении отсутствовали или были доступны только значения до лечения, мы рассчитывали стандартные отклонения с помощью формул, описанных в Кокрановском справочнике по систематическим обзорам вмешательств10, или рассчитывали их на основе данных цифр в статьях. Если авторы указали только медианы, мы использовали медианы как средние и межквартильные диапазоны / 1,35 как стандартные отклонения.12

Статистические методы

Мы провели попарный метаанализ случайных эффектов.Взвешенные средние различия и отношения шансов были представлены для непрерывных и бинарных переменных соответственно. Неоднородность оценивалась визуальным осмотром лесного участка и тестировалась с использованием статистики I ² .10 Для непрерывных данных мы использовали метод Дерсимона и Лэрда; для бинарных переменных мы провели одноэтапный метаанализ с использованием обобщенной линейной смешанной модели с точным биномиальным правдоподобием.

Затем мы провели частотный сетевой метаанализ для каждого результата отдельно.Для непрерывных переменных, таких как функциональные результаты и периоперационные параметры, мы выполнили сетевой метаанализ на основе контраста с использованием Stata (версия 14, Stata, College Station, TX) через сетевой модуль на основе команды mvmeta для множественных сравнений лечения с ограниченным подход максимального правдоподобия.13 Различия между исследованиями были уравновешены, корреляция была установлена ​​на 0,5, а доверительные интервалы были оценены на основе асимптотической дисперсии ошибок и нормального распределения.

Для дихотомических переменных, таких как осложнения, мы отметили редкие и нулевые события. Испытания с нулевыми событиями во всех группах для каждого результата были удалены во время анализа, поскольку они не предоставили ценной информации. Мы провели сетевой метаанализ на основе рук с использованием обобщенных линейных смешанных моделей14 с подходом ограниченного максимального правдоподобия. Расчет нулевого количества клеток не производился. Все анализы двоичных данных проводились с использованием процедуры GLIMMIX программного обеспечения SAS версии 9.4 (Институт SAS, Кэри, Северная Каролина) методом интегрирования Лапласа.

Мы оценили потенциальные несоответствия между прямыми и косвенными доказательствами в рамках сетевого метаанализа, используя модель взаимодействия «дизайн-лечение» 15 и метод бокового разделения. сеть. Метод разделения по сторонам разделял доказательства по конкретному сравнению на прямые и косвенные, а затем оценивал их различия.Статистическая значимость для всех анализов была установлена ​​на уровне 5%.

Мы также оценили вероятность попадания каждого вида лечения в каждый ранг для каждого вмешательства и результата. Мы получили иерархию лечения, используя поверхность под кривой совокупного ранжирования и средние ранги.17

Анализ чувствительности

Размер простаты может повлиять на результаты различных хирургических методов лечения, то есть большие простаты могут лучше подходить для лечения посредством энуклеации. методы, и менее эффективно лечится методами испарения.Мы выполнили мета-регрессионный анализ в соответствии со средним объемом простаты, представленным в каждом отчете об испытании. Чтобы повысить эффективность мета-регрессии, предполагая, что функциональные результаты будут аналогичны аналогичным хирургическим методам, мы сгруппировали девять методов по четырем типам: энуклеация, вапуризация, биполярная ТУРП и монополярная ТУРП. Мы определили большую группу простаты как имеющую средний объем простаты более 70 мл, а также провели анализ с пороговым значением 60 мл.Мы также сравнили средние различия Qmax и IPSS между этими четырьмя типами хирургических методов через 6, 12, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения. Далее мы сравнили кратковременное преходящее недержание мочи (<1 месяца после хирургического лечения) и частоту стойкого недержания (> 6-12 месяцев после хирургического лечения) между методами энуклеации (за исключением вапо-энуклеации) и резекции.

Участие пациентов и общественности

Это исследование было проведено без участия пациентов. Пациентам не предлагали прокомментировать дизайн исследования и не консультировали для разработки релевантных для пациента результатов или интерпретации результатов.Пациентам не предлагали участвовать в написании или редактировании этого документа для удобства чтения или точности. Результаты исследований будут распространяться среди пациентов и групп пациентов через социальные сети.

Результаты

Блок-схема на дополнительном рисунке 1 показывает процесс поиска литературы для получения подходящих исследований. Мы идентифицировали 1821, 3469 и 241 статью из PubMed, Embase и Кокрановских клинических испытаний, соответственно. После удаления 1564 повторяющихся статей общее количество статей составило 3967.Из них 3744 статьи были исключены на основании рефератов и обзоров заголовков. Из оставшихся 223 статей с полными текстами обзора 136 статей в 109 исследованиях соответствовали нашим критериям включения в систематический обзор и метаанализ. В 109 подходящих испытаниях приняли участие в общей сложности 13 676 участников и оценили девять различных хирургических методов лечения доброкачественной гиперплазии простаты с 21 прямым сравнением.

Из этих 109 испытаний в трех было три руки, а в 106 — две; большинство сравнений включали биполярную ТУРП, биполярную ВП, гольмиевую ЛЭП и КТР ЛВП с методами монополярной ТУРП (таблица 1; рис. 2).Клинические и методологические характеристики и изученные результаты каждого исследования представлены в дополнительных таблицах 2-4. Исходные характеристики, включая возраст, предоперационный IPSS, Qmax и качество жизни, были одинаковыми во всех испытаниях; однако средний объем простаты не был. Медианы и межквартильные диапазоны для возраста, Qmax, IPSS и качества жизни составили 67,8 (4,3), 7,2 (1,9), 23,3 (2,8) и 4,50 (0,60) соответственно. Среди 101 испытания, которое предоставило данные о среднем объеме простаты до операции, восемь, 74 и 19 испытаний показали средний объем простаты до 40, 40-70 и более 70 мл соответственно.

Рис. 2

Сетевые сравнения лечения для всех исследований, посвященных новым хирургическим методам лечения доброкачественной гиперплазии простаты. На рисунке показаны сравнения лечения (все включенные исследования, независимо от результатов), значения Qmax через шесть месяцев после хирургического лечения и значения Qmax через 12 месяцев после хирургического лечения. Размер узла соответствует количеству испытаний, в которых изучались методы лечения; вмешательства, которые сравниваются напрямую, соединяются линией, толщина которой соответствует количеству испытаний, в которых оценивались сравнения; количество попыток указано в строке.Сокращения хирургических методов перечислены в таблице 1

Оценка риска систематической ошибки Кокрановского сотрудничества показана на дополнительном рисунке 2. Высокий риск систематической ошибки был редкостью в любой области. Однако нечеткие оценки были обычным явлением, потому что в некоторых статьях не описывались методы рандомизации или были ли слепые участники или оценщики результатов. Что касается выборочной отчетности, только 33% испытаний (n = 36) были оценены как имеющие низкий риск систематической ошибки в сообщении об осложнениях, поскольку в них использовалась модифицированная классификация Clavien-Dindo18 или подробно сообщалось об осложнениях.

Функциональные исходы

Сеть подходящих сравнений для основного результата представлена ​​на рисунке 2 и дополнительном рисунке 3. В ходе анализа 51, 54, 18 и 14 испытаний сообщили о значениях Qmax при 6, 12, 24 и 36. месяцы после хирургического лечения соответственно; соответствующие числа для значений IPSS составляли 51, 53, 17 и 14 испытаний соответственно. Они включали преимущественно попарные сравнения биполярной ТУРП, биполярной ВП, гольмиевой LEP и KTP LVP с монополярной ТУРП для значений Qmax и IPSS через шесть и 12 месяцев после хирургического лечения.Результаты послеоперационного наблюдения через 24–36 месяцев были доступны только для семи из девяти хирургических методов, сравниваемых в нашем сетевом метаанализе. В большинстве исследований проводилось попарное сравнение биполярной и монополярной ТУРП или гольмиевый LEP и KTP LVP с биполярной или монополярной ТУР.

Мы обобщили наш метаанализ сети случайных эффектов и попарное сравнение функциональных результатов в дополнительных таблицах 5 и 7. Мы оценили сравнительные эффекты восьми новых методов против монополярной ТУР и вероятности SUCRA (рис. 3 и рис. 4; дополнительная таблица 6. и дополнительный рис. 5).

Рис. 3

Сетевой метаанализ функциональных результатов новых хирургических методов по сравнению с монополярной трансуретральной резекцией простаты (ТУРП) при доброкачественной гиперплазии простаты. Общие переменные неоднородности для всех сравнений в этом сетевом метаанализе включали: τ = 1,99, 1,13, 1,05 и 0,72 для значений Qmax через 6, 12, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения, соответственно, и τ = 1,60, 1,08, 0,98 и 0,75 для значений IPSS через 6, 12, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения соответственно.Процедуры ранжированы в соответствии со значениями SUCRA. SUCRA = поверхность по совокупному рейтингу. Сокращения хирургических методов приведены в таблице 1.

Рис. 4

Сетевой метаанализ периоперационных параметров и осложнений новых хирургических методов по сравнению с монополярной трансуретральной резекцией простаты при доброкачественной гиперплазии простаты. Общие переменные неоднородности для всех сравнений в этом сетевом метаанализе включали: τ = 0,39, 12,3, 0,56, 0,05, 0 и 0 для снижения гемоглобина, продолжительности катетеризации, удержания сгустка, переливания крови, повторной катетеризации и рецидива соответственно.Процедуры ранжированы в соответствии со значениями SUCRA. * 0 событий в группах нового метода или монополярных ТУРП. SUCRA = поверхность по совокупному рейтингу; единицей измерения продолжительности катетеризации и снижения гемоглобина являются часы и 10 г / л соответственно. Сокращения хирургических методов перечислены в таблице 1

Четыре метода энуклеации получили высокие оценки, за ними следуют методы резекции и вапоризации в отношении значений Qmax через шесть и 12 месяцев наблюдения (рис. 3). Средние различия значений Qmax составляли от 2.От 67 мл / с (95% доверительный интервал от 0,96 до 4,39) для лечения с наивысшим рейтингом (биполярный EP) до –0,68 мл / с (от –2,37 до 1,00) для лечения с самым низким рейтингом (KTP LVP) через шесть месяцев после хирургического лечения; и от 2,42 мл / с (от 1,11 до 3,73) для лечения с наивысшей оценкой (биполярный EP) до -1,90 мл / с (от -5,07 до 1,27) для лечения с самым низким рейтингом (диод LVP) через 12 месяцев после хирургического лечения. Для значения Qmax через 12 месяцев после хирургического лечения некоторые виды лечения (биполярная EP, гольмиевая LEP и биполярная ТУРПЖ) достигли статистической значимости по сравнению с монополярной ТУРП.Значительные различия и ранжирование были аналогичными через 24 и 36 месяцев после хирургического лечения.

Методы энуклеации также имеют более высокий рейтинг, чем методы резекции и вапоризации, по показателям IPSS через шесть и 12 месяцев после хирургического лечения (рис. 3). Средняя разница в значениях IPSS по сравнению с монополярной ТУРП варьировала от -0,62 (95% доверительный интервал -1,76 до 0,51) для лечения с наивысшей оценкой (биполярный EP) до 0,70 (от -2,26 до 3,66) для лечения с самым низким рейтингом (диод LVP). через шесть месяцев после хирургического лечения; и от −1.00 (от -2,41 до 0,40) для лечения с наивысшим рейтингом (диод LEP) до 1,30 (от -1,16 до 3,76) для лечения с самым низким рейтингом (диод LVP) через 12 месяцев после хирургического лечения.

Периоперационные параметры

Продолжительность катетеризации была указана в 82 исследованиях. Все методы с использованием энергии лазера (диод, тулий, гольмий, КТР) получили более высокий рейтинг, за ними следовала биполярная энергия, но все они оказались лучше, чем монополярная ТУРП. По сравнению с монополярной ТУРП длительность катетеризации уменьшилась с 43.07 часов (95% доверительный интервал от 29,96 до 56,17) для диодного LEP до 10,80 часов (от 6,15 до 15,44) для биполярной ТУРП (рис. 4).

Снижение гемоглобина было зарегистрировано в 68 исследованиях; Методы вапоризации и энуклеации были оценены выше, чем биполярная ТУРП, и все они были эффективнее, чем монополярная ТУР. По сравнению с монополярной ТУРП, снижение гемоглобина снизилось с 12,5 г / л (с 8,4 до 16,6) для метода с наивысшей оценкой (KTP LVP) до 1,9 г / л (от 0,1 до 3,8) для метода с самым низким рейтингом (биполярная ТУРП; рис. ).

Осложнения

Мы проанализировали краткосрочные осложнения, включая синдром трансуретральной резекции, повторную катетеризацию, задержку сгустка, переливание крови и недержание мочи, а также долгосрочные связанные осложнения, включая рецидивы, стриктуру уретры и ретроградную эякуляцию. Результаты сетевого метаанализа и попарного сравнения показаны в дополнительной таблице 7 и на дополнительном рисунке 6. Эти нежелательные явления были редкими и даже нулевыми в некоторых испытаниях; поэтому по некоторым вмешательствам не хватало данных для сравнения.

Что касается синдрома трансуретральной резекции, никаких событий в новых методах не сообщалось. О задержке сгустка и переливании крови сообщалось в 57 и 88 исследованиях соответственно. Методы испарения и энуклеации с использованием либо лазерной, либо биполярной энергии были оценены выше, чем биполярная ТУРП, и все они были эффективнее, чем монополярная ТУРП. По сравнению с монополярной ТУР ПЖ, отношение шансов составляло от 0,12 (95% доверительный интервал; 0,02 до 0,76) для биполярного ВП до 0,49 (от 0,32 до 0,74) для биполярной ТУР в отношении задержки сгустка и от 0.От 05 (от 0,01 до 0,22) для LEP гольмия до 0,42 (от 0,28 до 0,61) для биполярной ТУРП в отношении переливания крови.

В 71 испытании, в котором сообщалось о случаях повторной катетеризации, методы энуклеации имели более высокий рейтинг, чем методы резекции, в то время как методы вапоризации показали худшие результаты. По сравнению с монополярной ТУРП, отношение шансов варьировалось от 0,27 (95% доверительный интервал 0,11 до 0,69) для биполярного ВП до 2,17 (от 0,34 до 13,9) для диодного LVP. О рецидивах сообщалось в 29 исследованиях. Методы энуклеации и биполярной ТУРП более эффективны, чем методы вапоризации (рис. 4).

Ретроградная эякуляция, инфекция мочевыводящих путей, недержание мочи и стриктура были зарегистрированы в 17, 44, 50 и 83 исследованиях соответственно. Мы не увидели значительной разницы между новыми методами и монополярной ТУРП при этих осложнениях (дополнительный рисунок 6 и дополнительная таблица 5).

Анализ чувствительности и несогласованность

При объединении девяти методов в четыре группы мы обнаружили, что методы энуклеации улучшили Qmax на 1,98 мл / с (95% доверительный интервал от 0,55 до 3.41), 1,71 мл / с (от 0,53 до 2,88), 4,12 мл / с (от 1,11 до 7,12) и 4,82 мл / с (от 0,96 до 8,68) больше, чем у методов испарения через 6, 12, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения соответственно (таблица 2).

Таблица 2

Сеть оцененных средних различий (95% доверительный интервал) в послеоперационных значениях Qmax и IPSS для новых хирургических методов по сравнению с монополярной ТУРП при доброкачественной гиперплазии простаты

Что касается эффекта объема простаты, мета-регрессия показала, что средний объем простаты смягчил лечебный эффект.В группе большой простаты (средний объем простаты> 70 мл) методы энуклеации улучшили значения Qmax через шесть и 12 месяцев после хирургического лечения на 5,50 мл / с (95% доверительный интервал от 2,04 до 8,95) и 4,61 мл / с (от 0,85 до 8.36) больше, чем методы испарения, соответственно. Напротив, для среднего объема простаты менее 70 мл энуклеация улучшила значения Qmax только на 0,45 мл / с (от -1,03 до 1,93) и 0,52 мл / с (от -0,58 до 1,62) больше, чем при испарении через шесть и 12 месяцев соответственно. (дополнительная таблица 10).Методы энуклеации имели больше случаев кратковременного преходящего недержания мочи, чем методы резекции (отношение шансов 1,92, 1,39 к 2,65). Напротив, стойкое недержание мочи было редким, независимо от используемого метода (для энуклеации против отношение шансов резекции 1,23, от 0,29 до 5,22; дополнительный рисунок 7).

Мы не обнаружили доказательств глобальной несогласованности каких-либо первичных или вторичных исходов с использованием моделей взаимодействия «дизайн-лечение», за исключением продолжительности катетеризации. После удаления единственного испытания, сравнивающего биполярную ТУРП с тулиевым LEP, несоответствия больше не наблюдалось.Никакого существенного несоответствия между прямыми и косвенными сравнениями в моделях бокового разделения не наблюдалось (дополнительная таблица 9). Воронкообразные графики, скорректированные для сравнения, также не показали небольшой систематической ошибки исследования (дополнительный рисунок 4). Неоднородность была высокой при различных попарных сравнениях функциональных исходов и периоперационных параметров. Напротив, мы увидели низкую неоднородность осложнений (дополнительная таблица 5). Результаты GRADE и сетевое сравнение остаточной мочи после мочеиспускания, качества жизни по IPSS и пребывания в больнице показаны в дополнительной таблице 8 и на дополнительном рисунке 8.

Обсуждение

Основное открытие

Методы энуклеации, включая биполярный EP, гольмий, тулий и диодный LEP, дали более высокие значения Qmax, чем методы резекции и вапоризации, через 6-12 месяцев после хирургического лечения. Эта разница все еще наблюдалась через 24-36 месяцев после хирургического лечения. Методы энуклеации были более эффективными, чем методы испарения при больших размерах простаты. Методы энуклеации также показали лучший результат по IPSS, чем методы резекции и вапоризации, хотя разница не была статистически значимой.Новые методы были более безопасными, чем монополярная ТУРП, потому что переливание крови, задержка сгустка, снижение гемоглобина или синдром трансуретральной резекции были менее вероятными. Наши результаты подтвердили изменения в хирургическом лечении доброкачественной гиперплазии предстательной железы от монополярной ТУРПЖ к новым методам.

Хирургическое лечение обычно проводится, когда медикаментозное лечение не дает удовлетворительных результатов. Следовательно, когда рассматривается возможность хирургического вмешательства, пациенты становятся старше, что приводит к увеличению числа сопутствующих заболеваний.1920 Таким образом, исследованные здесь новые методы более подходят для этих пациентов. Цели лечения доброкачественной гиперплазии простаты заключаются не только в облегчении симптомов нижних мочевыводящих путей, но и в предотвращении нежелательных явлений, связанных с доброкачественной гиперплазией предстательной железы, таких как острая задержка мочи, ухудшение функции почек или дисфункция мочевого пузыря. Однако с широким использованием медикаментозного лечения распространенность побочных эффектов, связанных с доброкачественной гиперплазией предстательной железы, увеличилась с 1998 по 2008 год.2122 Кроме того, Фланиган и др. Обнаружили, что пациенты, перенесшие немедленную ТУРПЖ, имели большее улучшение Qmax и IPSS, чем те, кого наблюдали в течение длительного периода бдительного ожидания, 23 что, по-видимому, является следствием задержки в эффективном лечении. Поскольку новые хирургические методы демонстрируют меньше осложнений, но схожие или даже лучшие эффекты, чем монополярная ТУРП, можно рассмотреть возможность раннего хирургического лечения, чтобы избежать побочных эффектов, связанных с доброкачественной гиперплазией предстательной железы.

Методы энуклеации с использованием фиброоптических лазеров или биполярных петель имитируют открытую простатэктомию.24 Таким образом, тот факт, что методы энуклеации достигли лучших значений Qmax по сравнению с методами резекции и вапоризации, неудивителен, поскольку энуклеация удаляет больше ткани и приводит к большему снижению специфического антигена простаты, чем резекция и испарение.25 При медикаментозном лечении доброкачественной простаты. При гиперплазии альфа-блокаторы с ингибиторами 5-альфа-редуктазы или без них улучшают Qmax примерно на 0,9–2,4 мл / с по сравнению с плацебо, что считается клинически значимым.2627 В нашем исследовании было обнаружено, что методы энуклеации улучшают Qmax на 1,71–1,98 мл / с больше, чем методы вапоризации, и на 4,12 и 4,82 мл / с больше через 6–12 и 24–36 месяцев после хирургического лечения, соответственно. Следовательно, разница в Qmax между методами энуклеации и испарения была клинически значимой. Наш анализ также показал, что методы вапоризации, по-видимому, приводили к более высокой частоте рецидивов доброкачественной гиперплазии предстательной железы, чем методы энуклеации или резекции.

Предыдущий метаанализ шести рандомизированных контролируемых исследований с участием 541 пациента показал, что LEP гольмия достиг более высоких значений Qmax через 12 месяцев после хирургического лечения, чем монополярная ТУРП, хотя никаких различий в IPSS обнаружено не было.28 Другой метаанализ, сравнивающий KTP LVP с монополярной ТУРПЖ, включал шесть рандомизированных контролируемых испытаний и пять исследований случай-контроль с участием в общей сложности 889 пациентов29 и не обнаружил разницы в Qmax и IPSS, когда размер простаты был менее 70 мл, но Qmax и Значения IPSS в группе КТР LVP были ниже для размеров простаты более 70 мл. Наши результаты подтвердили, что методы энуклеации работают лучше, чем методы резекции, при использовании биполярной или лазерной энергии; однако метод испарения не подходил для больших простат.

Осложнения

Не сообщалось о возникновении синдрома трансуретральной резекции, связанного с восемью новыми методами. Что касается кровотечения, наше исследование показало, что восемь новых методов дали лучшие результаты, чем монополярная ТУРП, как во время операции, так и после операции. Методы энуклеации и вапоризации работают лучше, чем методы резекции, независимо от используемой энергетической системы. Испарение также вызывает эффекты коагуляции, что приводит к меньшему кровотечению. Только один раз во время процедуры энуклеации кровоточащий сосуд встречался в области капсулы, по сравнению с несколькими разами во время процедуры резекции.Эта разница могла способствовать снижению кровопотери, связанной с энуклеацией. Что касается послеоперационного кровотечения, более короткая продолжительность катетеризации и меньшее количество случаев задержки сгустка были связаны с меньшим послеоперационным кровотечением и лучшими гемостатическими эффектами. Энергия лазера, особенно диодов и КТР, показала преимущества перед биполярной и монополярной энергией при послеоперационном кровотечении. Более короткая продолжительность катетеризации и меньшее количество случаев задержки сгустка могут привести к более короткому пребыванию в больнице, снижению затрат на больницу и частоту повторной госпитализации.

Что касается частоты повторной катетеризации, методы энуклеации также были лучше, чем резекция, тогда как вапуризация была наихудшим методом. Методы энуклеации удаляют больше апикальной ткани простаты, тогда как методы вапоризации удаляют меньше апикальной ткани предстательной железы из-за риска повреждения сфинктера.30 Следовательно, некоторые хирурги резецируют верхушку простаты после испарения, чтобы преодолеть недостатки испарения.31

Наше исследование показали, что методы энуклеации дают лучшие функциональные результаты и эквивалентную безопасность, чем методы вапоризации.Однако риск кратковременного преходящего недержания мочи при энуклеации был выше, чем при методах резекции. Liu et al. Сравнили биполярную ВП с биполярной ТУРП и обнаружили, что после удаления Фолея частота недержания мочи была выше при энуклеации, чем при методах резекции, через 24 часа 32, в то время как через две недели после хирургического лечения разницы не было обнаружено. Поэтому некоторые авторы использовали вапоэнуклеацию или модифицированные методы для снижения частоты преходящего недержания мочи. 33

Монополярные электроды или лазеры на иттриево-алюминиевом гранате, легированном неодимом, использовались для испарения простаты.Однако они не получили широкого распространения из-за худших долгосрочных результатов, снижения эффективности или увеличения количества осложнений по сравнению с монополярной ТУРП.3034. Наши результаты показывают, что новые методы вапоризации по-прежнему обеспечивают более низкий Qmax или IPSS, чем методы энуклеации и резекции. Однако эти различия в основном наблюдались при больших размерах простаты. Кроме того, этот метод легче выполнять и вызывает меньшее кровотечение, особенно при использовании КТР и диодных лазеров. Следовательно, испарение простаты с использованием новых энергетических систем является многообещающим методом для пациентов с меньшей простатой или более высоким риском кровотечения, а также для пациентов, которые больше подходят для амбулаторной хирургии.Некоторые авторы пытались использовать гибридный метод (испарение с резекцией) для повышения эффективности испарения.35 По мере развития высокоэнергетических лазерных технологий ожидается повышение эффективности испарения. Может ли это улучшить функциональные результаты, особенно у пациентов с большой простатой, потребует дальнейших исследований.36

Что касается биполярной энергии, мы одновременно оценивали биполярную энуклеацию, резекцию и вапуризацию. Эффективность и частота осложнений были выше при биполярной ВП и биполярной ТУР, чем при монополярной ТУР.По сравнению с лазерными системами аппарат для биполярной энергии является многофункциональным, а оборудование и медицинские расходные материалы менее дороги.37 Биполярная энергия является многообещающей энергетической системой для хирургии доброкачественной гиперплазии простаты и более полезна в развивающихся странах. Использование методов энуклеации, резекции или испарения зависит от личных предпочтений хирурга и состояния пациента с учетом таких факторов, как объем простаты и сопутствующие заболевания.

Урологи предпочитают использовать методы резекции или энуклеации для лечения простаты больших размеров (> 70–80 мл), но предпочитают использование лазерных методов или методов вапоризации у пациентов с повышенным риском кровотечения.38 Более того, на выбор хирургического метода также влияют финансовые соображения, такие как полное возмещение затрат страховыми компаниями, наличие необходимого оборудования, а также навыки и опыт хирургов. Поскольку совместное принятие решений становится нормой в клинической помощи, клиницисты должны обсуждать со своими пациентами преимущества и риски различных хирургических подходов.

Сильные стороны и ограничения исследования

Сила нашего исследования заключается в том, что мы одновременно сравнили девять различных хирургических методов лечения доброкачественной гиперплазии простаты с использованием сетевого метаанализа.Мы сравнили значения Qmax и IPSS через 6, 12, 24 и 36 месяцев после хирургического лечения, чтобы оценить краткосрочные и среднесрочные эффекты различных методов лечения. Кроме того, мы включили рандомизированные контролируемые испытания без языковых ограничений, чтобы избежать предвзятости.

Наш сетевой мета-анализ имел некоторые ограничения. Во-первых, осложнения были редкими, и в некоторых испытаниях сообщалось об отсутствии событий, что привело к менее точной оценке объединенного отношения шансов. Тем не менее, неоднородность была низкой, и при попарных сравнениях предпочтение отдавалось новым методам.Во-вторых, функциональные результаты оценивались вслепую только в 14% исследований, что могло привести к смещению в пользу новых методов. Кроме того, во многих сравнениях первичных исходов была высокая неоднородность. Первоначальный объем простаты, степень уродинамической обструкции и опыт хирурга могут объяснить высокую неоднородность функциональных результатов. В-третьих, мы не анализировали ранние послеоперационные мочевые симптомы, такие как дизурия, позывы к мочеиспусканию или боль после мочеиспускания. Хотя эти симптомы влияют на краткосрочное удовлетворение пациента, они обычно улучшаются при медикаментозном лечении через два-три месяца после хирургического лечения.

В-четвертых, мы не дифференцировали вапоэнуклеацию от энуклеации, потому что определение и методика не стандартизированы. Следовательно, различия в результатах между вапоэнуклеацией и энуклеацией или разными методами энуклеации требуют дальнейшего изучения. Еще одним ограничением было то, что в наш обзор не вошли некоторые новые методы лечения доброкачественной гиперплазии простаты, такие как подтяжка уретры простаты, эмболизация артерии простаты, простая простатэктомия с помощью роботов и испарение воды.Подтяжка уретры и эмболизация артерии предстательной железы в основном используются у пациентов, не подходящих для хирургического вмешательства или анестезии, тогда как простая роботизированная простатэктомия показана для очень больших простат. Водное испарение было впервые введено в 2016 году, и его еще не сравнивали с ТУРП в рандомизированных контролируемых исследованиях. Поскольку целевая группа пациентов, использующих эти новые методы, отличается от той, которая представлена ​​в нашем обзоре, мы исключили эти методы из нашего сетевого метаанализа. Наконец, мы использовали средний размер простаты для каждой статьи в нашей мета-регрессии о связи между размером простаты и эффективностью лечения, потому что у нас не было индивидуальных данных о пациентах.Такой подход подвержен экологической предвзятости и искажению уровня исследования.

Заключение

По сравнению с монополярной ТУРП, восемь новых эндоскопических хирургических методов доброкачественной гиперплазии предстательной железы оказались более безопасными. Методы энуклеации показали лучшие Qmax и IPSS после операции, чем методы вапоризации и резекции. Эффективность испарения при больших размерах простаты требует дальнейших исследований для получения дополнительных доказательств.

Что уже известно по этой теме

• Монополярная трансуретральная резекция простаты долгое время была стандартным методом лечения доброкачественной гиперплазии простаты

• Многие новые энергетические системы (например, биполярные электроды или тулиевые, гольмиевые, диодные и др.) или калий-титанилфосфатные лазеры) появились в 2000 году и использовались для трансуретрального лечения доброкачественной гиперплазии предстательной железы

Что добавляет это исследование

• Все методы эндоскопической энуклеации (включая биполярные электроды или гольмиевые, тулиевые или диодные лазеры ) показали лучшие функциональные результаты, чем методы вапоризации и резекции.

• Восемь новых хирургических методов с использованием биполярного электрода или лазерного лечения превосходили контроль кровотечения (во время и после операции) по сравнению с монополярной трансуретральной резекцией простаты

The Translation Zone | Издательство Принстонского университета

Перевод до 11 сентября считался в первую очередь инструментом международных отношений, бизнеса, образования и культуры.Сегодня это более чем когда-либо кажется вопросом войны и мира. В работе «Зона перевода » Эмили Аптер утверждает, что область исследований перевода, обычно ограниченная рамками лингвистической верности оригиналу, созрела для расширения в качестве основы для новой сравнительной литературы.

Организованная вокруг серии предложений, которые варьируются от идеи о том, что ничто не может быть переведено, до идеи о том, что все переводимо, Зона перевода исследует жизненно важную роль переводческих исследований в «изобретении» сравнительной литературы как дисциплины.Аптер подчеркивает «языковые войны» (включая роль неправильного перевода в военном искусстве), лингвистическую несоизмеримость в переводческих исследованиях, противоречие между текстовым и культурным переводом, роль перевода в формировании глобального литературного канона, сопротивление англоязычному господству и влияние переводческих технологий на само понятие перевода. Книга обращается к разным дисциплинам и охватывает весь земной шар.

В конечном счете, Зона перевода утверждает, что новая сравнительная литература должна учитывать политическое влияние переводческих технологий на определение иностранных или символических языков в гуманитарных науках, одновременно признавая сложность языковой политики в мире. одноязычный и более многоязычный.

Эмили Аптер — профессор французского языка и сравнительной литературы в Нью-Йоркском университете. Ее последняя книга — «Дрейф континентов: от национальных персонажей к виртуальным предметам» .

«Это потрясающая книга, и ее приятно читать. В то же время творческий и провокационный, остроумный анализ Аптера многоязычия в литературе вносит важный вклад в целый ряд дисциплин, от переводоведения, сравнительной литературы и лингвистики, постколониальных исследований до основные литературные исследования на французском и английском языках.Что настолько необычно, так это впечатляющая широта и диапазон чтения Аптера в литературе по всему миру. Это книга, которая заставит читателей захотеть переосмыслить пределы их собственных дисциплин и повторно перевести используемые ими концепции », — Роберт Дж. К. Янг, Оксфордский университет, автор книги Постколониализм: историческое введение

« Перевод Zon e предлагает богато подробную историю сравнительной литературы, область, изменчивую с самого начала, смотрящую в противоположные горизонты, и никогда больше, чем в настоящий момент.Эмили Аптер исследует дороги, которые использовались и не использовались в прошлом, связывая их с новыми, перекрестно оплодотворенными языками, которые составляют и активизируют поле деятельности в будущем », — Вай Чи Димок, автор книги Через другие континенты: американская литература через глубокие

границ | Сравнительный геномный анализ позволяет по-новому взглянуть на молекулярные основы движения в устье у Kalanchoë fedtschenkoi

Введение

Метаболизм крассуловой кислоты (CAM) представляет собой адаптацию растений, которая включает механизм концентрации углерода, основанный на временном разделении фиксации CO ₂ (Ehleringer and Monson, 1993), чему способствует перевернутая модель устьичного движения день / ночь. закрытие и открытие по сравнению с C ₃ или C ₄ видами фотосинтеза (Males and Griffiths, 2017).В частности, виды CAM открывают устьица ночью, позволяя поглощать атмосферный CO ₂ , который превращается в малат для хранения в вакуоли. В течение дня CO ₂ высвобождается из малата, когда устьица закрыты, что приводит к накоплению CO ₂ вокруг Рубиско для нормальных фотосинтетических процессов (Ehleringer and Monson, 1993). Кроме того, инверсия движения устьиц является важным механизмом предотвращения засухи / устойчивости к засухе у растений фотосинтеза САМ, благодаря которому потеря воды, вызванная эвапотранспирацией, уменьшается, и, следовательно, эффективность использования воды увеличивается.Инженерия этих признаков у видов, не являющихся CAM, имеет большой потенциал для генетического улучшения засухоустойчивости сельскохозяйственных культур, что требует глубокого понимания молекулярных механизмов, лежащих в основе движения устьиц у растений фотосинтеза CAM (Borland et al., 2014; Yang et al., 2015).

Помимо исследования устьиц в CAM, в последнее время в целом увеличилось количество исследований устьиц (Рисунок 1). У всех растений устьица играют важную роль в контроле потерь воды, вызванных транспирацией, и поглощением CO ₂ для фотосинтеза, модуляции потока воды, вызванного транспирацией, через континуум почва-растение-атмосфера и адаптации растений к изменяющимся условиям окружающей среды и стрессам ( Damour et al., 2010). Понимание развития, движения и формирования устьиц может облегчить инженерные усилия по улучшению этих характеристик. Однако сегодня две проблемы сдерживают развитие стоматологических исследований. Во-первых, большая часть работ по изучению этих устьичных отростков была проведена на растении модели C ₃ Arabidopsis thaliana . Это может представлять проблему при желании передать знания, полученные в результате этих исследований, другим видам, поскольку гены, участвующие в этих процессах, могут различаться в регуляции и / или функции, как видно у видов CAM (Abraham et al., 2016; Самцы и Гриффитсы, 2017; Yang et al., 2017), а у травяных видов Brachypodium distachyon (Raissig et al., 2016, 2017). Во-вторых, гомология между последовательностями белков может помочь сделать вывод о функции белка (Clark and Radivojac, 2011), но проблема в том, что функциональная информация о многих белках отсутствует в базах данных аннотаций или скрыта в научной литературе. Например, интересующий белок может быть гомологичен белку, который функционирует в процессе, связанном с устьицами, но эта информация неизвестна, потому что охарактеризованный белок не имеет аннотации генной онтологии (GO).

Рисунок 1. Количество публикаций в год, связанных с исследованиями устьиц и замыкающих клеток с 1949 года. Результаты поиска в базе данных PubMed с использованием ключевых слов «устьица» (A) и «замыкающая клетка» (B) .

Существуют инструменты интеллектуального анализа текста, которые можно использовать для поиска информации о похожих белках, комбинируя поиск BLAST со ссылками на статьи из определенных баз данных (Gilchrist et al., 2008; Li et al., 2013; Jaroszewski et al., 2014). Однако эти инструменты не ищут литературу, что ограничивает их анализ. Недавно был разработан новый веб-инструмент под названием PaperBLAST (Price and Arkin, 2017), который объединяет поиск по гомологии последовательностей и анализ текста связанных статей для прогнозирования функции белка. PaperBLAST может решить две проблемы, с которыми сталкиваются исследования устьиц, описанные выше, и, следовательно, помочь в обнаружении молекулярных механизмов, лежащих в основе перевернутого движения устьиц, наблюдаемого у видов CAM.

В этом исследовании мы впервые идентифицировали малоизученные гены, связанные с устьицами, которые не содержат аннотаций, связанных с устьицами, но были связаны с процессами, связанными с устьицами, с помощью PaperBLAST.Затем мы идентифицировали гены, которые могли быть вовлечены в инвертированное движение устьиц у растений CAM посредством сравнительного анализа данных по экспрессии генов во времени между облигатными видами фотосинтеза CAM ( Kalanchoë fedtschenkoi ) и двумя видами фотосинтеза C ₃ ( A. thaliana и Solanum lycopersicum ). Наше исследование значительно расширило каталог генов, связанных с устьицами у растений, предоставив ресурс для будущей экспериментальной работы по изучению устьиц немодельных видов и, что более важно, предоставив гены-мишени для инженерии CAM-подобных признаков у видов, не относящихся к CAM.

Материалы и методы

Ортологические группы и филогенетический анализ

Группы ортологов, состоящие из белков 26 видов растений, были получены от Yang et al. (2017). Для филогенетического анализа выравнивания последовательностей белков были созданы с использованием сетевой программы MUSCLE с параметрами по умолчанию (Katoh and Standley, 2013; McWilliam et al., 2013; Li et al., 2015). Филогенетические деревья были созданы на основе выравнивания последовательностей белков с использованием веб-программы IQ-Tree с параметрами по умолчанию (Trifinopoulos et al., 2016).

Генный онтологический анализ белковых последовательностей

Термины онтологии генов A. thaliana и K. fedtschenkoi были взяты из информации аннотации генов, загруженной из Phytozome v12.1 (Goodstein et al., 2012). Правосторонний гипергеометрический тест обогащения при средней сетевой специфичности в ClueGO (Bindea et al., 2009) использовался для выявления биологических процессов, чрезмерно представленных в отдельных наборах генов. Метод понижения Холма-Бонферрони (Holm, 1979) был применен для коррекции значения p .Минимальный и максимальный пороги для выбранных уровней GO-дерева составляли 3 и 8, соответственно, в то время как отдельные кластеры должны были включать не менее 3% генов, связанных с каждым термином GO. Чтобы свести к минимуму избыточность GO-термина, были выбраны параметры объединения и группирования GO-термина, и репрезентативный член для каждого функционального кластера был определен как термин, обогащенный на самом высоком уровне значимости. Члены GO со значениями p меньше или равными 0,05 считались значительно обогащенными.

Интеллектуальный анализ данных с использованием PaperBLAST

Чтобы включить множество эволюционных линий, протеомы 13 репрезентативных видов растений, включая Amborella trichopoda (базальные покрытосеменные, C ₃ фотосинтез), Ananas comosus (однодольные, фотосинтез CAM), A. thaliana (двудольные растения). , C ₃ фотосинтез), B. distachyon (однодольные, C ₃ фотосинтез), K. fedtschenkoi (двудольные, фотосинтез CAM), Mimulus guttatus (двудольные, C

0 3940 фото) Musa acuminata (однодольные, C ₃ фотосинтез), Oryza sativa (однодольные, C ₃ фотосинтез), Phalaenopsis equestris (однодольные, фотосинтез CAM), Setaria italocnthesis 440y. ), с.lycopersicum (двудольные, C ₃ фотосинтез), Sorghum bicolor (однодольные, фотосинтез C ₄ ) и Vitis vinifera (двудольные, C ₃ фотосинтез) были загружены из базы данных Van PLAZA 4.0 (база данных БелАЗА 4.0). et al., 2017; Дополнительная таблица S1). Каждую последовательность белка использовали в качестве поискового запроса в PaperBLAST (Price and Arkin, 2017) с использованием порогового значения E , равного 1e-3. Последующие файлы HTML содержат различную информацию о гомологичных белках, такую ​​как функциональная информация, название статьи и текстовые фрагменты из статей, содержащих идентификаторы гомологичных белков.Файлы HTML были собраны и проанализированы путем поиска любого присутствия ключевых слов, связанных с устьицами (например, «устьица» и «защитная клетка») в данных, связанных с каждым обращением к PaperBLAST, с использованием собственных скриптов Python. Все гомологичные белки, которые не содержали ключевых слов в связанных данных, были отфильтрованы. Соответствующие извлеченные данные для каждого вида обобщены в дополнительной таблице S2.

Анализ данных по экспрессии генов с течением времени

Данные экспрессии diel для K.fedtschenkoi взяты из Yang et al. (2017), которые были получены в результате секвенирования транскриптома (RNA-Seq) образцов ткани целого листа, собранных с 2-часовыми интервалами у растений, выращенных при 12-часовом световом цикле / 12-часовом темноте. Данные по экспрессии diel для A. thaliana были взяты из Mockler et al. (2007), которые были получены из образцов, собранных с 4-часовыми интервалами с растений, выращенных при цикле 12 часов света / 12 часов темноты. Считывания сырых РНК-Seq для S. lycopersicum были взяты из архива считывания последовательностей DDBJ под номерами доступа DRA003529 и DRA0035530, которые были получены из образцов цельного листа, собранных каждые 2 часа с растений, выращенных при 10-часовом освещении / 14 -h темный цикл (Хигаши и др., 2016). Необработанные чтения секвенирования S. lycopersicum были проверены на качество с помощью FastQC (Andrew, 2014), обрезаны с использованием Trimmomatic v0.36 (Bogler et al., 2014) с параметрами по умолчанию, а качество снова проверено FastQC. Обрезанные считывания РНК-Seq S. lycopersicum были сопоставлены с эталонным геномом S. lycopersicum iTAG v2.3 с использованием TopHat2 v1.0.1 (Kim et al., 2013) с использованием параметров по умолчанию. Счетчик считываний был рассчитан с использованием Cufflink v2.2.1 (Trapnell et al., 2012), а количество фрагментов на килобазу транскрипта на миллион отображенных считываний (FPKM) было рассчитано.Обработка всех сырых данных секвенирования проводилась с использованием Kbase (Arkin et al., 2018). Гены со средним FPKM менее 0,01 и менее чем в половине их точек отбора проб, имеющих FPKM, равное нулю, были отфильтрованы из наборов данных экспрессии K. fedtschenkoi и S. lycopersicum . После предыдущих работ с использованием набора данных транскриптома A. thaliana (Abraham et al., 2016; Yang et al., 2017; Moseley et al., 2018) данные A. thaliana были скорректированы для получения выражения профили в той же шкале времени, что и К.Данные по экспрессии генов fedtschenkoi и S. lycopersicum . В частности, алгоритм кубической интерполяции в библиотеке Python pandas использовался для моделирования данных экспрессии гена A. thaliana в дополнительных временных точках, так что все три набора данных состояли из точек выборки, расположенных каждые 2 часа в течение 24-часового периода.

Сравнительный анализ экспрессии генов

Сравнительный анализ экспрессии транскриптов между сумерками и рассветом временного окна был выполнен, как описано Yang et al.(2017). Для K. fedtschenkoi и A. thaliana окно сумерек покрывает 10, 12 и 14 часов после начала светового периода, а окно рассвета охватывает 22, 24 и 2 часа после начала светового периода. световой период (дополнительный рисунок S1). Для S. lycopersicum , который выращивался при несколько ином световом режиме, чем K. fedtschenkoi и A. thaliana , сумеречное окно закрывает 8, 10 и 12 после начала светового периода, а окно рассвета охватывает 22, 24 и 2 часа после начала светового периода (дополнительный рисунок S1).Для каждого вида любые гены с отрицательными уровнями экспрессии генов удаляли, и данные экспрессии для каждого гена нормализовали, как описано в Yang et al. (2017). Была создана матрица из двух столбцов, где строки представляли гены, один столбец представлял сумму всех преобразованных моментов времени сумерек, а другой столбец представлял сумму всех преобразованных моментов времени рассвета. Для каждого гена использовался правосторонний точный тест Фишера, чтобы определить, была ли экспрессия этого гена повышена в сумерках, на рассвете или в обоих случаях, в соответствии с таблицами сопряженности, описанными в Yang et al.2017; (Дополнительный рисунок S1). Точный тест Фишера был выполнен с использованием функции fisher_exact из библиотеки scipy Python. Коэффициент ложного обнаружения (Benjamini and Hochberg, 1995) контролировался для каждого вида и временного окна при значении p <0,05. Этот сравнительный анализ был проведен для идентификации групп ортологов, содержащих измененную экспрессию генов у видов CAM, по сравнению с видами C ₃ , в которых ген S. lycopersicum и A. thaliana были обогащены в одном временном окне тогда как K.ген fedtschenkoi был обогащен в противоположном временном окне (то есть, рассвет против сумерек).

Результаты

Идентификация генов, связанных с устьицами

Наш анализ PaperBLAST белковых последовательностей 13 видов растений выявил в среднем 5 196 белков на вид, которые могут участвовать в процессах, связанных с устьицами, что составляет в среднем 16,4% соответствующего генома растения (дополнительная таблица S3). Всего 321 белок в базе данных PaperBLAST содержал данные, содержащие ключевые слова «устьица» и «замыкающая клетка» (таблица 1).Большинство этих белков (304) были белками A. thaliana , на втором месте (9) были белки S. lycopersicum . Только A. thaliana и S. lycopersicum имели белки, которые соответствовали всем 321 белкам в базе данных PaperBLAST (дополнительная таблица S3). Каждый белок в PaperBLAST связан с публикацией (ами), содержащей информацию о соответствующем белке. Было каталогизировано 272 публикации, содержащие по крайней мере один из 321 белка (дополнительная таблица S3).Поскольку большинство из 321 белка были белками A. thaliana и что A. thaliana является хорошо аннотированным организмом, были исследованы аннотации 304 белков A. thaliana . Используя текущую аннотацию белков A. thaliana , 178 белков были аннотированы терминами, относящимися к устьицам или замыкающим клеткам. Также были добавлены еще 20 генов, которые, как известно, играют ключевую роль в движении и развитии устьиц (Ohashi-Ito and Bergmann, 2006; MacAllister et al., 2007; Пиллиттери и др., 2007; Канаока и др., 2008; Kollist et al., 2014), всего 198 белков, связанных с устьицами, с функциональной аннотацией либо GO, либо известных как ключевые гены, связанные с устьицами (дополнительная таблица S4). Среди 304 белков, связанных с устьицами A. thaliana в базе данных PaperBLAST, только 97 белков были аннотированы как связанные с устьицами в базе данных GO или описаны как ключевые гены, связанные с устьицами, что указывает на то, что 207 генов, связанных с устьицами, пропущены GO и скрыто в научной литературе (дополнительная таблица S5 и рисунок 2A).Эти 207 генов будут далее называться малоизученными генами / белками, относящимися к устьицам. Биологические процессы, чрезмерно представленные в этих 207 недостаточно изученных белках, связанных с устьицами A. thaliana , включают передачу сигналов, процессы, связанные с фосфорилированием, и несколько процессов ответа (рис. 2В).

Таблица 1. Виды растений с белками, относящимися к устьицам, в базе данных PaperBLAST.

Рисунок 2. Оценка и идентификация новых генов, связанных с устьицами. (A) Перекрытие генов Arabidopsis thaliana с аннотациями, относящимися к устьицам, известным как ключевые гены устьиц и идентифицированным в базе данных PaperBLAST как относящиеся к устьицам. GO: гены, аннотированные как связанные с устьицами в результате анализа генной онтологии. Известно: гены, известные в литературе как родственные устьицам. PaperBLAST: гены, относящиеся к устьицам, идентифицированные с помощью поиска PaperBLAST. (B) Обогащение онтологии генов 207 новыми устьичными генами A. thaliana . (C) Перекрытие групп ортологов между новыми генами, связанными с устьицами, в A.thaliana (Арт), Solanum lycopersicum (Soly) и Kalanchoë fedtschenkoi (Kafe).

PaperBLAST использует пороговое значение E , равное 1e-3, чтобы сделать вывод о гомологии между двумя белками, и, как правило, это ограничение E может быть надежно использовано для этой цели (Pearson, 2013). Однако для получения более надежного набора генов, связанных с устьицами для каждого вида, были извлечены группы ортологов (OG) 321 белка, связанных с процессами, связанными с устьицами, в PaperBLAST.При создании этих OG Ян и др. (2017) использовали более строгий порог значения E , равный 1e-5, чтобы сделать вывод о гомологии и включили белки из 26 видов растений. Всего было извлечено 257 OG для 321 белка, связанного с процессами, связанными с устьицами, в PaperBLAST. По отдельности количество белков от каждого вида, которые разделяют тот же самый OG, что и белок PaperBLAST, варьировалось от чуть более 500 белков в A. trichopoda до более 1200 белков в обоих A. thaliana и Musa acuminata (дополнительная таблица S6 ).Дальнейшая категоризация этих OG в зависимости от того, были ли белки соответствующих видов ортологичны белку A. thaliana в любой из трех категорий генов устьиц (т. Е. Аннотированы как связанные с устьицами / замыкающими клетками, известные ключевые гены устьиц или недостаточно изученные гены, относящиеся к устьицам) показаны в дополнительной таблице S7.

Переназначенная экспрессия Diel устьичных генов в

K. fedtschenkoi

Предполагается, что изменение структуры экспрессии гена diel сыграло роль в эволюции растений CAM из растений C ₃ (Yang et al., 2017). Чтобы определить, может ли какой-либо из генов K. fedtschenkoi , ортологичных гену A. thaliana в любой из трех категорий генов устьиц, играть роль в инверсии паттерна движения устьиц день / ночь, сравнивали их профили экспрессии. к профилям экспрессии их ортологов в S. lycopersicum и A. thaliana . В частности, профили экспрессии генов 188 OG, которые были отобраны, поскольку они содержали гены, относящиеся к устьицам, идентифицированные в предыдущем разделе в K.fedtschenkoi, S. lycopersicum и A. thaliana (рис. 2C).

Два критерия были использованы для идентификации генов, связанных с устьицами, которые демонстрируют измененную (рассвет или сумерки) экспрессию генов у видов фотосинтеза CAM ( K. fedtschenkoi ) по сравнению с двумя видами фотосинтеза C ₃ ( S. и A. thaliana ): (1) Ген K. fedtschenkoi должен быть значительно обогащен на рассвете или в сумерках, тогда как ген S.lycopersicum и Ортологи A. thaliana должны быть значительно обогащены в противоположном временном окне (т. е. рассвет или закат), и (2) ген K. fedtschenkoi должен иметь коэффициент ранговой корреляции копейщика <-0,6 с ортологи S. lycopersicum и A. thaliana , тогда как ортологи S. lycopersicum и A. thaliana должны иметь между собой коэффициент ранговой корреляции Спирмена> 0,6. На основе этих двух критериев было идентифицировано 16 OG, которые содержат гены, связанные с устьицами, с измененным графиком (рассвет vs.dusk) экспрессия гена у видов фотосинтеза CAM по сравнению с двумя видами фотосинтеза C ₃ (таблица 2 и дополнительный рисунок S2). Среди этих 16 OG, связанных с устьицами, только два OG содержат генов A. thaliana , аннотированных как гены, связанные с устьицами: CIPK23 (AT1G30270) и RCAR3 (AT5G53160) (Таблица 2). Остальные 14 OG содержат генов A. thaliana , которые не аннотированы и не известны как ключевые гены, связанные с устьицами, но, как сообщается в литературе, участвуют в процессе, связанном с устьицами, или, другими словами, недостаточно изучены гены, связанные с устьицами .

Таблица 2. Ортологичные гены в Arabidopsis thaliana, Solanum lycopersicum и Kalanchoë fedtschenkoi , которые демонстрировали дифференциальное обогащение экспрессии генов между сумерками и рассветом.

Эволюционная динамика генов, связанных со стомой

Три вида растений, изученных здесь, претерпели несколько раундов дупликации всего генома (Yang et al., 2017), что может привести к появлению нескольких копий (то есть паралогов) одного гена.В целом, дупликации генов способствовали развитию новых функций (например, адаптации к стрессу) через последующие динамические события, которые могут происходить после дупликации генов, такие как субфункционализация и неофункционализация (Yang et al., 2006; Panchy et al., 2016). Чтобы лучше понять эволюционную динамику, которая поддерживала CAM, возникающую из C ₃ , были исследованы филогенетические отношения внутри 16 OG. Используя A. trichopoda , который является базальным видом покрытосеменных растений (Albert et al., 2013), как внешняя группа, филогенетические деревья были построены для каждой OG.

OG, содержащий ген A. thaliana RCAR3, также включает два паралога A. thaliana , идентифицированных как RCAR1 (AT1G01360) и RCAR2 (AT4G01026). Только два гена из K. fedtschenkoi и S. lycopersicum были помещены в этот OG каждый. В этом OG были идентифицированы два субклада, один из которых содержит A. thaliana паралогов RCAR1 и RCAR2 и S. lycopersicum ген (SL08G082180), а другой субклад содержит A.thaliana RCAR3, ген S. lycopersicum (SL03G007310) и два гена K. fedtschenkoi (Kaladp0008s0082 и Kaladp0042s0353) (дополнительный рисунок S3). Гены RCAR, как известно, действуют как рецепторы ABA и опосредуют ABA-зависимую регуляцию протеинфосфатаз типа 2C (Ma et al., 2009). В присутствии ABA гены RCAR ингибируют активность фосфатаз протеинфосфатаз типа 2C, что позволяет протеинкиназам протеинкиназы 2, связанным с SNF1, активировать компоненты, участвующие в регуляции движения устьиц (Culter et al., 2010; Рагхавендра и др., 2010). Ген K. fedtschenkoi RCAR3 был идентифицирован как имеющий перепланированную экспрессию гена относительно A. thaliana RCAR3, но не S. lycopersicum RCAR3 (дополнительный рисунок S3). Предыдущая работа, посвященная изучению временных различий в экспрессии генов между видами CAM Agave Americana и A. thaliana , обнаружила аналогичные доказательства перепланированной экспрессии генов между ортологами RCAR3 (Abraham et al., 2016). Определение конкретных ролей каждого гена RCAR в передаче сигналов ABA, особенно у видов CAM, необходимо для лучшего понимания различий в экспрессии их генов между видами CAM и C ₃ и влияние этих различий на движение устьиц.

Филогенетическое дерево OG, содержащее A. thaliana ген устойчивости к мучнистой росе (PMR6, AT3G54920), продемонстрировало богатую эволюционную динамику, поскольку в этом OG было обнаружено несколько генов от каждого из трех видов (дополнительный рисунок S4).Перепланированные гены, идентифицированные в этом исследовании, не были расположены рядом друг с другом в эволюционном смысле, поскольку гены S. lycopersicum (SL03G111690, SL05G014000) были обнаружены на расстоянии нескольких событий ветвления от A. thaliana (AT3G54920) и K. fedtschenkoi (Kaladp0024s0371). Однако гены A. thaliana и K. fedtschenkoi были тесно связаны друг с другом, а также с одним геном A. thaliana (AT5G04310) и K.fedtschenkoi (Kaladp0008s0911) каждый и три гена S. lycopersicum (SL03G071570, SL05G055510 и SL11G008140). Kaladp0024s0371, идентифицированный как измененный относительно гена A. thaliana PMR6, преимущественно экспрессируется в течение дня, тогда как ген A. thaliana PMR6 преимущественно экспрессируется в конце ночного времени (дополнительный рисунок S4). Остальные близкородственные гены показали аналогичную экспрессию, охватывающую примерно то же временное окно, что и A.thaliana ген PMR6. PMR6 кодирует пектатлиазеподобный белок, и было показано, что мутации в PMR6 изменяют состав клеточной стенки растений за счет увеличения пектина (Vogel, 2002). Более того, устьица открываются больше у мутантов pmr6 , чем у мутантов дикого типа, вероятно, из-за повышенной жесткости клеточной стенки замыкающей клетки (Woolfenden et al., 2017). Здесь невозможно определить, способствовало ли изменение состава клеточной стенки в течение дня инверсии устьичных движений, наблюдаемой у растений САМ.Дальнейшее исследование временной динамики состава клеточной стенки в замыкающих клетках CAM растений дало бы лучшие ключи к разгадке роли PMR6 в движении устьиц и физиологии замыкающих клеток у CAM растений в целом.

Два OG, содержащие малоизученные гены, имели уверенно построенные деревья с корнями вне группы, причем один OG содержал протеинкиназы, а другой — каталазы. Протеинкиназа OG содержала два гена A. thaliana , которые, как сообщается, участвуют в световой активации открытия устьиц: APK1a (AT1G07570) и APK1b (AT2G28930) (Elhaddad et al., 2014), а третий, как сообщается, участвует в реакции на осмотический стресс, вызванной АБК, NAK (AT5G02290) (Kodama et al., 2009). Ген A. thaliana NAK сформировал субклад с тремя генами S. lycopersicum и двумя генами K. fedtschenkoi (рис. 3A), потенциально представляя события дупликации после расхождения от общего предка. Было обнаружено, что ген Kaladp0058s0603 ( NAK1 ) K. fedtschenkoi NAK изменил график экспрессии по сравнению с геном A.thaliana NAK и один из генов S. lycopersicum NAK (SL06G010850). Остальные гены NAK в S. lycopersicum и K. fedtschenkoi демонстрировали экспрессию, охватывающую примерно то же временное окно, что и их соответствующие паралоги. Информации о функциональной роли NAK мало, но Kodama et al. (2009) сообщили, что в условиях засухи АБК индуцирует экспрессию гена NAK. NAK аутофосфорилирует, мигрирует в ядро ​​и фосфорилирует последующие белки.Они предполагают, что это приводит к модуляции ядерной функции, чтобы справиться со стрессом обезвоживания. K. fedtschenkoi NAK1 достигает пика утром, тогда как гены NAK в растениях C ₃ экспрессируются в сумерках. CAM возник как адаптация к среде с ограниченным количеством воды, поэтому перепланированная экспрессия гена реакции на осмотический стресс, который тесно связан с генами, участвующими в открытии устьиц, представляет собой интересный способ эволюции CAM.

Рисунок 3. Перепланированная диэль экспрессия генов, связанных с устьицами, у видов фотосинтеза CAM ( K. fedtschenkoi ) по сравнению с двумя видами фотосинтеза C ₃ ( A. thaliana и S. lycopersicum ). (A) Филогенетическое дерево генов протеинкиназ и тепловые карты экспрессии генов NAK у A. thaliana, S. lycopersicum и K. fedtschenkoi . (B) Филогенетическое дерево генов каталазы и тепловые карты экспрессии генов CAT2 в A.thaliana, S. lycopersicum и K. fedtschenkoi . Названия генов в красном тексте указывают на гены, которые обогащаются на рассвете или в сумерках.

Каталаза OG содержала по три гена в каждом из двух видов фотосинтеза C ₃ ( A. thaliana и S. lycopersicum ), что согласуется с предыдущим исследованием (Mhamdi et al., 2012). Однако в каталазе OG было 6 генов K. fedtschenkoi , что может быть результатом недавней дупликации всего генома в K.fedtschenkoi (Yang et al., 2017). Ген A. thaliana в каталазе OG, выделенный на фиг. 3B, который содержит измененную экспрессию гена у видов CAM по сравнению с видами C ₃ , помечен как каталаза 2 (CAT2) (таблица 2). CAT2 является частью фотодыхательного пути и способствует детоксикации H ₂ O ₂ (Queval et al., 2007; Mhamdi et al., 2010, 2012). Клада CAT2 в филогенетическом дереве каталазы OG (рис. 3B) включает все гены, перечисленные в таблице 2 для этого OG, но также включает еще K.fedtschenkoi (Kaladp0052s0025), что предполагает наличие двух генов CAT2 в K. fedtschenkoi . Гены A. thaliana и S. lycopersicum имеют повышенную и максимальную экспрессию утром, а также один из генов K. fedtschenkoi CAT2 ( CAT2.1 ) (рис. 3B). Второй ген K. fedtschenkoi ( CAT2.2 ) имеет повышенную экспрессию и достигает пика в сумерках (рис. 3В). Это представляет интересный сценарий, поскольку белки, которые кодирует каждый ген каталазы, играют относительно специфические роли в определении накопления H ₂ O ₂ , продуцируемого различными метаболическими путями (Mhamdi et al., 2012).

Обсуждение

Исследования роли устьиц в контроле потери воды и газообмена, а также в обеспечении защиты от изменяющихся условий окружающей среды и стрессов в последнее время активизировались с целью понимания молекулярных механизмов, лежащих в основе этих свойств. Однако функциональная информация, полученная в результате этих исследований, либо отсутствует в базах аннотаций, либо скрыта в научной литературе (Price and Arkin, 2017), что препятствует прогрессу в исследованиях функциональной геномики для получения глубокого и всестороннего понимания устьиц. гены.Чтобы облегчить эту проблему, в этом исследовании были выявлены гены, которые не были ни аннотированы, ни известны как ключевые гены, связанные с устьицами, у 13 видов растений, но в литературе сообщалось, что они участвуют в процессе, связанном с устьицами. Чтобы продемонстрировать полезность этого нового ресурса для генов, связанных с устьицами, был исследован молекулярный механизм инверсии движения устьиц у видов CAM относительно видов C ₃ с использованием наборов генов, созданных для одного вида CAM ( K.fedtschenkoi ) и два вида C ₃ ( A. thaliana и S. lycopersicum ). Несколько генов были идентифицированы как кандидаты для дальнейшего исследования перевернутого движения устьиц при САМ.

В литературе было обнаружено чуть более 300 генов, участвующих в процессах, связанных с устьицами, большинство из которых принадлежит A. thaliana . Гены, связанные с устьицами, были идентифицированы у каждого из 13 видов растений, использованных в этом исследовании, с помощью PaperBLAST.Подмножество генов для каждого вида было дополнительно классифицировано на основе сходства последовательностей с генами A. thaliana , обнаруженными с помощью PaperBLAST, которые были либо ранее аннотированными / известными генами, связанными с устьицами, либо недостаточно изученными генами, связанными с устьицами. Недоизученные гены, связанные с устьицами, о которых сообщается в этом исследовании, могут послужить отличным источником для будущих исследований молекулярных механизмов, лежащих в основе процессов, связанных с устьицами, особенно у видов, не относящихся к арабидопсису. Гены, идентифицированные у 12 видов растений, кроме A.thaliana может иметь другие функциональные роли, даже если они принадлежат к той же группе ортологов. Например, недавно сообщалось, что ортологичные гены, участвующие в развитии устьиц и формировании паттерна у B. distachyon и A. thaliana , обнаруживают дивергенцию в функции и регуляции устьиц, хотя они и являются ортологичными генами (Raissig et al. , 2016, 2017).

Для исследования молекулярного механизма (ов), который может помочь объяснить инверсию устьичных движений, наблюдаемую у растений CAM, по сравнению с растениями C ₃ , был изучен недавно созданный список гомологичных генов, связанных с устьицами, у 13 видов растений.CAM-растения закрывают устьица в течение дня, чтобы снизить скорость транспирации, что позволяет им лучше переносить стресс засухи, чем растения C ₃ . АБК играет важную роль в реакции растений на засуху, способствуя закрытию устьиц (Vishwakarma et al., 2017), а у растений CAM концентрация АБК была изменена до пика прямо перед утром (Abraham et al., 2016). Ген NAK был охарактеризован как индуцируемый АБК в условиях засухи (Kodama et al., 2009) и был идентифицирован в списке гомологичных генов, связанных с устьицами, как имеющих измененную экспрессию генов между K. fedtschenkoi и двумя видами C ₃ . Предполагая, что ген NAK1 в K. fedtschenkoi выполняет ту же функцию, что и его ортолог A. thaliana , можно предположить, что сдвиг в его экспрессии, вероятно, может быть результатом или результатом изменения концентраций ABA. Эта гипотеза может быть проверена с помощью молекулярной генетики и функциональных подходов в будущем (например,g., характеристика нокаутных мутантов nak1 у K. fedtschenkoi ). Определение роли NAK1 в K. fedtschenkoi и его связи с движением устьиц может дать новое понимание молекулярных механизмов, которые CAM-растения используют для адаптации к сухой среде. Более того, идентификация регулятора NAK1 также может помочь в понимании передачи сигналов ABA и, следовательно, закрытия устьиц у CAM-растений.

Дополнительный ген, идентифицированный в списке гомологичных генов, связанных с устьицами, как подвергшийся изменению расписания экспрессии генов в K.fedtschenkoi относительно вида C ₃ был ген каталазы CAT2. Обычно в геноме растения есть три гена каталазы, и каждый ген считается функционально консервативным для разных видов (Mhamdi et al., 2012). Специфичный для гена CAT2, CAT2 экспрессируется в фотосинтетических клетках мезофилла и замыкающих клетках, участвует в фотодыхании и демонстрирует ритмы день-ночь в изобилии транскриптов с пиками утром (Zhong et al., 1994; Zhong and McClung, 1996). ; Queval et al., 2007; Mhamdi et al., 2010; Mhamdi et al., 2012). Основная роль CAT2 заключается в детоксикации H ₂ O ₂ , в частности H ₂ O ₂ , образующегося в результате фотосинтеза (Mhamdi et al., 2010). Рубиско — это бифункциональный фермент, который также катализирует оксигенацию RuBP, который производит 2-фосфогиликолят в качестве одного из своих продуктов. Эта небольшая молекула не метаболизируется через цикл Кальвина-Бенсона, но дефосфорилируется с образованием гликолата, который транспортируется к пероксисомам.Внутри пероксисом гликолат окисляется до глиоксилата с использованием кислорода в качестве кофактора, что приводит к образованию H ₂ O ₂ . Это производство отрицательно контролируется CAT2 (рис. 4A).

Фигура 4. Роль каталазы 2 (CAT2) в растениях C ₃ и в растениях CAM. (A) Роль CAT2 в фотодыхании у C ₃ растений. (B) Фотодыхание снижено у растений САМ. (C) Роль CAT2 в открытом закрытии устьиц (вверху) и открытии (внизу) у C ₃ растений. (D) Предполагаемая роль CAT2 в закрытии устьиц (вверху) и открытии (внизу). Красные вопросительные знаки указывают на неизвестные взаимодействия, требующие дальнейшего расследования. RuBP, рибулозо-1,5-бифосфат; PGA, 3-фосфоглицериновая кислота; 2-PG, 2-фосфогиликолат; I _{ca2 +} , Ca ²⁺ каналов; H ₂ O ₂ , перекись водорода; RBOH, респираторные взрывные оксидазы.

CAM — это механизм уменьшения фотодыхания за счет уменьшения соотношения CO ₂ : O ₂ в клетках (рис. 4B).У других организмов, которые разработали метод снижения выработки гликолата, основная судьба гликолата — выведение или окисление до глиоксилата через митохондриальную дегидрогеназу с использованием NAD ⁺ в качестве конечного акцептора электронов (Stabenau and Winkler, 2005). Так ли это в случае K. fedtschenkoi , еще предстоит определить, однако наши результаты предполагают пониженную роль CAT2.1 в K. fedtschenkoi . Интересно, что CAT2, по-видимому, дублируется в K. fedtschenkoi , причем одна копия имеет консервативную экспрессию гена, а другая копия экспрессируется на рассвете (рис. 3B).В исследовании A. thaliana было обнаружено, что CAT2 участвует в передаче сигналов ABA для закрытия устьиц, поскольку мутанты cat2 значительно усиливают ABA-индуцированное закрытие устьиц (Jannat et al., 2011). Эти авторы представили модель, в которой ABA активирует оксидазы респираторного взрыва (RBOHs) в мембранах замыкающих клеток, что приводит к быстрой продукции H ₂ O ₂ в замыкающих клетках (Kwak et al., 2003). Затем H ₂ O ₂ активирует каналы Ca ²⁺ , вызывая закрытие устьиц в ночное время (Pei et al., 2000; Мурата и др., 2001; Рисунок 4C). CAT2 играет отрицательную роль в передаче сигналов ABA при закрытии устьиц, детоксифицируя замыкающие клетки. Это приводит к тому, что каналы Ca ²⁺ не активируются, что оставляет устьица открытыми (рис. 4C). В связи с ролью CAT2 в открытии устьиц, мы предполагаем, что CAT2.2, экспрессируемая в сумерках у K. fedtschenkoi , может играть роль в открытии устьиц, ингибируя АБК-индуцированное закрытие устьиц за счет снижения H ₂ O ₂ концентрации (рис. 4D).Несколько других авторов предположили, что активация H ₂ O ₂ каналов Ca ²⁺ представляет собой возможную точку схождения для множественных сигнальных путей стресса (Gechev and Hille, 2005; Sewelam et al., 2014; Niu and Liao, 2016). Функциональная характеристика обоих генов CAT2 в K. fedtschenkoi необходима для определения каких-либо ролей в открытии устьиц, а также для определения того, регулируется ли CAT2.2 циркадным ритмом. Дальнейшее определение роли передачи сигналов H ₂ O ₂ в K.fedtschenkoi требуется устьичное движение.

Таким образом, это исследование каталогизировало сотни малоизученных генов, связанных с устьицами, у многих видов растений, включая растения фотосинтеза C3, C4 и CAM. Мы также идентифицировали многочисленные недостаточно изученные гены, связанные с устьицами, которые демонстрировали измененную экспрессию генов между ортологами у одного вида CAM и двух видов C ₃ , обеспечивая ценных кандидатов для CAM-инженерии в культурах фотосинтеза C3 для повышения устойчивости к засухе.Кроме того, было подчеркнуто влияние дупликации и диверсификации генов на эволюцию CAM, подчеркивая эволюционную динамику, вовлеченную в эволюцию CAM.

Авторские взносы

RM и XY задумали исследование. RM выполнил все анализы данных и написал рукопись. GT и XY внесли свой вклад во время исследования и отредактировали рукопись.

Финансирование

Автором этой рукописи является UT-Battelle, LLC по контракту № DE-AC05-00OR22725 с Министерством энергетики США.Это исследование было поддержано Министерством энергетики США, Управлением науки, Программой геномных наук под номером DE-SC0008834 и Центром инноваций в области биоэнергетики. Национальная лаборатория Ок-Ридж находится под управлением UT-Battelle, LLC для Министерства энергетики США в соответствии с номером контракта DE-AC05-00OR22725.

Заявление о конфликте интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

Авторы выражают благодарность Дэвиду Уэстону, Маргарет Э. Стэйтон и Джею Чену за их критические комментарии к рукописи.

Дополнительные материалы

Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00292/full#supplementary-material

Сноски

1. https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/
2. http: // www.iqtree.org/
3. https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
4. https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html
5. https://pandas.pydata.org/
6. https://www.scipy.org/

Список литературы

Абрахам П. Э., Инь Х., Борланд А. М., Вейгилл Д., Лим С. Д., Де Паоли Х. С. и др. (2016). Временная динамика транскриптов, белков и метаболитов в агаве растений САМ. Нац. Растения 2: 16178.DOI: 10.1038 / nplants.2016.178

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Альберт, В. А., Барбазук, В. Б., деПамфилис, К. В., Дер, Дж. П., Либенс-Мак, Дж., Ма, Х. и др. (2013). геном амбореллы и эволюция цветковых растений. Science 342, 1241089–1241089. DOI: 10.1126 / science.1241089

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эндрю, С. (2014). FastQC Инструмент контроля качества для данных последовательности с высокой пропускной способностью. Берлин: ScienceOpen.

Google Scholar

Аркин А. П., Коттингем Р. У., Генри С. С., Харрис Н. Л., Стивенс Р. Л., Маслов С. и др. (2018). KBase: база знаний отдела биологии энергетических систем США. Нац. Biotechnol. 36, 566–569. DOI: 10.1038 / NBT.4163

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бенджамини Ю. и Хохберг Ю. (1995). Контроль ложного обнаружения: практичный и эффективный подход к множественному тестированию. J. R. Stat. Soc. Сер. В 57, 289–300. DOI: 10.1111 / j.2517-6161.1995.tb02031.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Биндеа Г., Млечник Б., Хакл Х., Чароентонг П., Тосолини М., Кириловский А. и др. (2009). ClueGO: плагин Cytoscape для расшифровки функционально сгруппированных онтологий генов и сетей аннотаций путей. Биоинформатика 25, 1091–1093. DOI: 10.1093 / биоинформатика / btp101

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Борланд, А.М., Хартвелл, Дж., Вестон, Д. Дж., Шлаух, К. А., Чаплински, Т. Дж., Тускан, Г. А. и др. (2014). Разработка метаболизма крассулоидной кислоты для повышения эффективности использования воды. Trends Plant Sci. 19, 327–338. DOI: 10.1016 / j.tplants.2014.01.006

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Culter, S., Rodriquez, P., Finkelstein, R., and Abrams, S. (2010). Абсиковая кислота: появление основной сигнальной сети. Annu. Rev. Plant Biol. 61, 651–679.DOI: 10.1146 / annurev-arplant-042809-112122

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Damour, G., Simonneau, T., Cochard, H., and Urban, L. (2010). Обзор моделей устьичной проводимости на уровне листа. Plant Cell Environ. 33, 1419–1438. DOI: 10.1111 / j.1365-3040.2010.02181.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Элерингер, Дж. Р., и Монсон, Р. К. (1993). Эволюционные и экологические аспекты изменения пути фотосинтеза. Annu. Rev. Ecol. Syst. 24, 411–439. DOI: 10.1146 / annurev.es.24.110193.002211

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Эльхаддад, Н.С., Хант, Л., Слоан, Дж., И Грей, Дж. Э. (2014). На открытие устьиц, индуцированное светом, влияет протеинкиназа замыкающих клеток APK1b. PLoS One 9: e97161. DOI: 10.1371 / journal.pone.0097161

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гилкрист, М. Дж., Кристенсен, М. Б., Харланд, Р., Pollet, N., Smith, J.C., Ueno, N., et al. (2008). Уклонение от узкого места аннотации: использование сходства последовательностей для поиска данных генов, не относящихся к последовательностям. BMC Bioinformatics 9: 442. DOI: 10.1186 / 1471-2105-9-442

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гудштейн, Д. М., Шу, С., Хоусон, Р., Нойпан, Р., Хейс, Р. Д., Фазо, Дж. И др. (2012). Фитозома: сравнительная платформа для геномики зеленых растений. Nucleic Acids Res. 40, D1178 – D1186.DOI: 10.1093 / nar / gkr944

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хигаси Т., Танигаки Ю., Такаяма К., Нагано А. Дж., Хондзё М. Н. и Фукуда Х. (2016). Обнаружение суточных вариаций транскриптома томатов с помощью метода молекулярного расписания на фабрике растений солнечного типа. Фронт. Plant Sci. 7:87. DOI: 10.3389 / fpls.2016.00087

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Холм, С. (1979). Простая процедура многократного последовательного отбраковки. Сканд. J. Stat. 6, 65–70.

Google Scholar

Джаннат Р., Ураджи М., Морофуджи М., Хоссейн М. А., Ислам М. М., Накамура Ю. и др. (2011). Роль CATALASE2 в передаче сигналов абсцизовой кислоты в замыкающих клетках Arabidopsis. Biosci. Biotechnol. Biochem. 75, 2034–2036. DOI: 10.1271 / bbb.110344

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Канаока, М. М., Пиллиттери, Л. Дж., Фуджи, Х., Йошида, Ю., Богеншуц, Н.L., Takabayashi, J., et al. (2008). SCREAM / ICE1 и SCREAM2 определяют три стадии перехода между клеточными состояниями, ведущие к дифференцировке устьиц Arabidopsis. Растительная клетка 20, 1775–1785. DOI: 10.1105 / tpc.108.060848

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Като, К., Стэндли, Д. М. (2013). Программное обеспечение MAFFT для множественного выравнивания последовательностей, версия 7: улучшения производительности и удобства использования. Мол. Биол. Evol. 30, 772–780. DOI: 10.1093 / molbev / mst010

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ким, Д., Пертеа, Г., Трапнелл, К., Пиментел, Х., Келли, Р., и Зальцберг, С. (2013). TopHat2: точное выравнивание транскриптомов при наличии вставок, делеций и слияний генов. Genome Biol. 14, 1–13. DOI: 10.1186 / GB-2013-14-4-r36

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кодама Ю., Тамура Т., Хирасава В., Накамура К. и Сано Х. (2009). Новый путь фосфорилирования белков, участвующий в реакции на осмотический стресс у растений табака. Biochimie 91, 533–539. DOI: 10.1016 / j.biochi.2009.01.003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Квак, Дж. М., Мори, И. К., Пей, З., Леонхард, Н., Торрес, М., Дангл, Дж. И др. (2003). НАДФН-оксидаза Гены AtrbohD и AtrbohF участвуют в ROS-зависимой передаче сигналов ABA у Arabidopsis. EMBO J. 22, 2623–2633. DOI: 10.1093 / emboj / cdg277

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, В., Коули, А., Uludag, M., Gur, T., McWilliam, H., Squizzato, S., et al. (2015). Сеть биоинформатики и программных инструментов EMBL-EBI. Nucleic Acids Res. 43, W580 – W584. DOI: 10.1093 / nar / gkv279

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ma, Y., Szostkiewicz, I., Korte, A., Moes, D., Yang, Y., Christmann, A., et al. (2009). Регулятор активности фосфатазы PP2C функционирует как сенсоры абсцизовой кислоты. Наука 324, 1064–1068. DOI: 10.1126 / наука.1172408

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Макаллистер К., Охаши-Ито К. и Бергманн Д. К. (2007). Фактор транскрипции контролирует асимметричные деления клеток, которые устанавливают устьичное происхождение. Природа 445, 537–540. DOI: 10.1038 / nature05491

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

McWilliam, H., Li, W., Uludag, M., Squizzato, S., Park, Y.M, Buso, N., et al. (2013). Веб-сервисы инструмента анализа от EMBL-EBI. Nucleic Acids Res. 41, W597 – W600. DOI: 10.1093 / nar / gkt376

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Mhamdi, A., Queval, G., Chaouch, S., Vanderauwera, S., Van Breusegem, F., and Noctor, G. (2010). Функция каталазы в растениях: акцент на мутанты Arabidopsis как модели, имитирующие стресс. J. Exp. Бот. 61, 4197–4220. DOI: 10.1093 / jxb / erq282

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Моклер, Т., Майкл, Т. П., Прист, Х. Д., Шен, Р., Салливан, К. М., Гиван, С. А. и др. (2007). Дневной проект: профилирование суточной и циркадной экспрессии, сопоставление с образцом на основе модели и анализ промотора. Холодный. Spring Harb. Symp. Quant. Биол 72, 353–363. DOI: 10.1101 / sqb.2007.72.006

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мозли Р. К., Мевалал Р., Мотта Ф., Тускан Г. А., Хаас С. и Янг X. (2018). Сохранение и диверсификация циркадной ритмичности между модельным растением с метаболизмом крассулоидной кислоты kalanchoe fedtschenkoi и растением фотосинтеза модели C3 Arabidopsis thaliana . Фронт. Plant Sci. 9: 1757. DOI: 10.3389 / fpls.2018.01757

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мурата Ю., Пей З., Мори И. К. и Шредер Дж. И. (2001). Активация абсцизовой кислотой ca2 каналов плазматической мембраны в замыкающих клетках требует цитозольного NAD (P) H и дифференцированно нарушается выше и ниже продукции активных форм кислорода у мутантов abi1-1 и abi2-1 протеинфосфатазы 2C. Растительная клетка 13, 2513–2523.DOI: 10.1105 / tpc.13.11.2513

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ню, Л., Ляо, В. (2016). Передача сигналов перекиси водорода в развитии растений и абиотических ответах: перекрестные помехи с оксидом азота и кальцием. Фронт. Plant Sci. 7: 230. DOI: 10.3389 / fpls.2016.00230

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Охаши-Ито К. и Бергманн Д. К. (2006). Arabidopsis FAMA контролирует окончательный переключатель пролиферации / дифференцировки во время развития устьиц. Растительная клетка 18, 2493–2505. DOI: 10.1105 / tpc.106.046136

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пей, З., Мурата, Ю., Беннинг, Г., Томин, С., Клюзенер, Б., Аллен, Г. и др. (2000). Каналы кальция, активируемые перекисью водорода, опосредуют передачу сигналов абсцизовой кислоты в замыкающих клетках. Природа 406, 731–734. DOI: 10.1038 / 35021067

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пиллиттери, Л. Дж., Слоан, Д., GBogenschutz, N., и Torli, K. (2007). Прекращение асимметричного деления клеток и дифференцировка устьиц. Природа 445, 501–505. DOI: 10.1038 / nature05467

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Queval, G., Issakidis-Bourguet, E., Hoeberichts, F. A., Vandorpe, M., Gakiere, B., Vanacker, H., et al. (2007). Условные реакции на окислительный стресс у фотодыхательного мутанта cat2 арабидопсиса демонстрируют, что окислительно-восстановительное состояние является ключевым модулятором зависимой от продолжительности светового дня экспрессии генов, и определяют фотопериод как решающий фактор в регуляции гибели клеток, индуцированной h3O2. Plant J. 52, 640–657. DOI: 10.1111 / j.1365-313X.2007.03263.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Raissig, M. T., Abrash, E., Bettadapur, A., Vogel, J. P., and Bergmann, D. C. (2016). Травы используют альтернативно подключенную сеть факторов транскрипции bHLH для установления идентичности устьиц. Proc. Natl. Акад. Sci. США 113, 8326–8331. DOI: 10.1073 / pnas.1606728113

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Раиссиг, М.Т., Матос, Дж., Гил, М., Корнфельд, А., Беттадапур, А., Абраш, Э. и др. (2017). Mobile MUTE определяет вспомогательные клетки для создания физиологически улучшенных устьиц травы. Наука 355, 1215–1218. DOI: 10.1126 / science.aal3254

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Севелам, Н., Джасперт, Н., Ван дер Келен, К., Тоннетти, В. Б., Шмитц, Дж., Фреригманн, Х., и др. (2014). Специфичность пространственной передачи сигнала h3O2: H ₂ O ₂ из хлоропластов и пероксисом дифференцированно модулирует транскриптом растения. Мол. Завод 7, 1191–1210. DOI: 10.1093 / mp / ssu070

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Стабенау Х. и Винклер У. (2005). Метаболизм гликолата в зеленых водорослях. Physiol. Растение. 123, 235–245. DOI: 10.1111 / j.1399-3054.2005.00442.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Trapnell, C., Robert, A., Goff, L., Pertea, G., Kim, D., Kelley, D., et al. (2012). Анализ дифференциальной экспрессии генов и транскриптов в экспериментах с последовательностью РНК с TopHat и Cufflinks. Нац. Protoc. 7, 562–578. DOI: 10.1038 / nprot.2012.016

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Трифинопулос, Дж., Нгуен, Л. Т., фон Хезелер, А., и Мин, Б. К. (2016). W-IQ-TREE: быстрый онлайн-филогенетический инструмент для анализа максимального правдоподобия. Nucleic Acids Res. 44, W232 – W235. DOI: 10.1093 / nar / gkw256

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван Бел, М., Дильс, Т., Ванкаестер, Э., Крефт, Л., Botzki, A., Van de Peer, Y., et al. (2017). PLAZA 4.0: интегративный ресурс для функциональной эволюционной и сравнительной геномики растений. Nucleic Acids Res. 46, D1190 – D1196. DOI: 10.1093 / nar / gkx1002

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вишвакарма К., Упадхьяй Н., Кумар Н., Ядав Г., Сингх Дж., Мишра Р. К. и др. (2017). Передача сигналов абсцизовой кислоты и устойчивость к абиотическому стрессу у растений: обзор текущих знаний и перспектив на будущее. Фронт. Plant Sci. 8: 161. DOI: 10.3389 / fpls.2017.00161

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Woolfenden, H.C., Bourdais, G., Kopischke, M., Miedes, E., Molina, A., Robatzek, S., et al. (2017). Вычислительный подход для определения свойств клеточной стенки, которые управляют динамикой замыкающих клеток. Plant J. 92, 5–18. DOI: 10.1111 / tpj.13640

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Янг, X., Cushman, J.К., Борланд, А. М., Эдвардс, Э. Дж., Вулльшлегер, С. Д., Тускан, Г. А. и др. (2015). Дорожная карта для исследований метаболизма кислоты толстолистых (CAM) для улучшения устойчивого производства продуктов питания и биоэнергии в более жарком и сухом мире. New Phytol. 207, 491–504. DOI: 10.1111 / Nph.13393

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ян, X., Ху, Р., Инь, Х., Дженкинс, Дж., Шу, С., Тан, Х. и др. (2017). Геном каланхоэ дает представление о конвергентной эволюции и строительных блоках метаболизма кислоты толстянковых. Нац. Commun. 8, 1–15. DOI: 10.1038 / s41467-017-01491-7

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Янг, X., Тускан, Г.А., и Ченг, М.З. (2006). Дивергенция семейств генов Dof у тополя, арабидопсиса и риса предполагает множественные способы эволюции генов после дупликации. Plant Physiol. 142, 820–830. DOI: 10.1104 / стр.106.083642

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжун, Х., Мак-Клунг, К.(1996). Циркадные часы контролируют экспрессию двух генов каталазы Arabidopsis в разные и противоположные циркадные фазы. Мол. Genet Genet. 251, 196–203.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Чжун, Х., Янг, Дж., Пиз, Э., Хангартер, Р., и МакКланг, К. (1994). Взаимодействие между светом и циркадными часами в регуляции экспрессии CAT2 у Arabidopsis. Plant Physiol. 104, 889–898. DOI: 10.1104 / стр.104.3.889

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Что следует знать о сравнительной небрежности в Нью-Йорке

‍

Сравнительная небрежность — интересная тема для обсуждения в штате Нью-Йорк законов о несчастных случаях и о травмах.Если кто-то ранен или попал в аварию, самый большой вопрос, который решает большинство судов, заключается в том, виновата ли одна из сторон. Но что, если обе стороны разделяют хотя бы часть вины? В разных штатах этот вопрос решается по-разному. Здесь, в Нью-Йорке, доктрина, которая применяется к случаям, когда может быть более одной ответственной стороны, называется сравнительной небрежностью.

Веб-сайт Findlaw определяет халатность как проявление «когда один человек действует неосторожно, что каким-то образом (прямо или косвенно) причиняет телесные повреждения или вред другому человеку.«Суды обычно находят кого-то небрежным, когда они определяют, что этот человек не проявил обычной осмотрительности по отношению к кому-то, перед кем они были обязаны проявлять заботу.

Проблема возникает, когда обнаруживается, что несколько человек, участвовавших в инциденте, проявили халатность. В Нью-Йорке закон предусматривает определение степени халатности вовлеченной стороны. Например, если истец по несчастному случаю несет хотя бы частичную ответственность за случившееся, это называется небрежностью со стороны участников.В случае автомобильной аварии, если один водитель превышал скорость, а другой водитель не использовал указатель поворота, обе стороны проявили халатность. В некоторых штатах небрежность может лишить истца возможности взыскать убытки по иску. Но Нью-Йорк не входит в число таких штатов.

На что следует обратить внимание при содействии небрежности в штате Нью-Йорк

Закон, регулирующий халатность в штате Нью-Йорк, содержится в разделе 1411 Гражданско-правовых норм и правил штата (CPLR). В нем говорится:

«В любых действиях по взысканию убытков в связи с телесными повреждениями, материальным ущербом или противоправной смертью виновное поведение, вменяемое истцу или умершему, включая соучастие в халатности или принятии риска, не должно препятствовать взысканию, но сумма убытков, подлежащих взысканию, должна быть уменьшена пропорционально виновному поведению истца или умершего лица к виновному поведению, которое причинило ущерб.

Проще говоря, истцам в Нью-Йорке не препятствуют взыскать убытки в случаях телесных повреждений, даже если они несут частичную ответственность, но сумма, которую они взыскивают, будет уменьшена пропорционально сумме их вины.

Присяжные в деле о телесных повреждениях должны сначала определить, был ли ответчик небрежным, а затем они должны решить, виноват ли истец.

Ответчик должен доказать, что истец несет хотя бы частичную ответственность.Как только это будет сделано, последняя задача жюри — распределить вину между двумя сторонами. Это делается на процентной основе. Процент неисправности должен составлять 100 процентов. Например, присяжные могут установить, что ответчик несет ответственность за несчастный случай на 70 процентов, а истец — на 30 процентов. Истцу не запрещается взыскать убытки, но сумма взыскания будет на 30 процентов меньше.

Закон штата Нью-Йорк о сравнительной небрежности упрощает взыскание убытков, но также делает дела о телесных повреждениях более сложными.Адвокатское бюро Микеля Дж. Хоффмана имеет более чем 30-летний опыт ведения таких дел. Позвоните сегодня или заполните нашу контактную форму, чтобы получить бесплатную консультацию.

Информация в этом материале не предназначена для использования в качестве юридической консультации. Проконсультируйтесь с юристами для получения конкретной информации о ваших индивидуальных ситуациях.

Лос-Аламос, Поверенный по травмам Нью-Мексико

Личные поверенные по травмам в Альбукерке »Сравнительная небрежность

Нью-Мексико — штат, относящийся к категории относительной небрежности.Это означает, что потерпевшая сторона («истец») может нести частичную ответственность за свои травмы. Если будет установлено, что потерпевшая сторона несет частичную ответственность за аварию, любое возмещение убытков будет уменьшено на сумму сравнительной вины истца.

В некоторых штатах действует модель соучастия в халатности. В случае сопутствующей небрежности, если будет установлено, что потерпевшая сторона несет полную ответственность за аварию или возникшие в результате травмы, возмещение ущерба полностью запрещено.Это очень тяжелый результат, поскольку, возможно, в каждом случае может быть минимальное количество ошибок.

В случаях сравнительной небрежности жюри определит вину каждой стороны. Если есть сравнительная ошибка, то жюри должно распределить ошибку в процентах, например 50/50, 60/40 или какой-либо другой расчет соответствующей ошибки сторон. Как только это будет сделано присяжными, сумма компенсации за убытки будет уменьшена на сумму вины, приписываемой истцу.

Такой же расчет производится до судебного разбирательства между соответствующими поверенными, когда стороны пытаются договориться об урегулировании.Это часто вызывает горячие споры. Часто защита заявляет о высокой степени относительной небрежности. Во многих случаях защита вообще отказывается признать какую-либо ответственность, утверждая, что авария произошла исключительно по вине истца. Эти дела станут предметом судебного разбирательства, и по ним, скорее всего, будет вынесен судебный приговор.

Сравнительная небрежность возникает во всех случаях небрежности в отношении травм. Этот вопрос необходимо решить на раннем этапе для справедливой оценки ваших требований.Если проблема присутствует, скорее всего, проблема будет повторно оценена несколько раз в процессе обнаружения. При оценке ваших претензий важно рационально решить этот вопрос. Невыполнение этого требования может привести к плачевным результатам испытаний.